·tooluniverse-spatial-omics-analysis
{}

tooluniverse-spatial-omics-analysis

空間マルチオミクスデータ統合のための計算解析フレームワーク。空間可変遺伝子 (SVG)、空間ドメイン アノテーション、組織タイプ、空間トランスクリプトミクス/プロテオミクス実験 (10x Visium、MERFISH、DBiTplus、SLIDE-seq など) からの疾患コンテキストを考慮して、経路濃縮、細胞間相互作用推論、創薬可能標的の同定、免疫微小環境の特性評価、マルチモーダル統合などの包括的な生物学的解釈を実行します。 Spatial Omics Integration Score (0-100)、ドメインごとの特性評価、および検証の推奨事項を含む詳細なマークダウン レポートを作成します。 9 つの分析フェーズにわたって 70 以上の ToolUniverse ツールを使用します。ユーザーが空間トランスクリプトミクス解析、空間オミクス解釈、組織の不均一性、空間的遺伝子発現パターン、腫瘍微小環境マッピング、組織の帯状分布、または空間データからの細胞間コミュニケーションについて質問する場合に使用します。

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インストール

$npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis

tooluniverse-spatial-omics-analysis のインストール方法

コマンドラインで tooluniverse-spatial-omics-analysis AI スキルを開発環境にすばやくインストール

  1. ターミナルを開く: ターミナルまたはコマンドラインツール(Terminal、iTerm、Windows Terminal など)を開きます
  2. インストールコマンドを実行: このコマンドをコピーして実行します: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis
  3. インストールを確認: インストール後、スキルは自動的に AI コーディング環境に設定され、Claude Code、Cursor、OpenClaw で使用できるようになります

ソース: mims-harvard/tooluniverse。

Comprehensive biological interpretation of spatial omics data. Transforms spatially variable genes (SVGs), domain annotations, and tissue context into actionable biological insights covering pathway enrichment, cell-cell interactions, druggable targets, immune microenvironment, and multi-modal integration.

| svgs | Yes | Spatially variable genes (gene symbols) | ['EGFR', 'CDH1', 'VIM', 'MYC', 'CD3E'] | | tissuetype | Yes | Tissue/organ type | brain, liver, lung, breast, skin | | technology | No | Spatial omics platform used | 10x Visium, MERFISH, DBiTplus, SLIDE-seq |

| diseasecontext | No | Disease if applicable | breast cancer, Alzheimer disease, liver cirrhosis | | spatialdomains | No | Dict mapping domain name to marker genes | {'Tumor core': ['MYC','EGFR'], 'Stroma': ['VIM','COL1A1']} | | celltypes | No | Cell types identified in deconvolution | ['Epithelial', 'T cell', 'Macrophage', 'Fibroblast'] |

引用可能な情報

AI/検索での引用用の安定したフィールドとコマンド。

インストールコマンド
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis
カテゴリ
{}データ分析
認証済み
初回登録
2026-02-20
更新日
2026-03-10

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クイックアンサー

tooluniverse-spatial-omics-analysis とは?

空間マルチオミクスデータ統合のための計算解析フレームワーク。空間可変遺伝子 (SVG)、空間ドメイン アノテーション、組織タイプ、空間トランスクリプトミクス/プロテオミクス実験 (10x Visium、MERFISH、DBiTplus、SLIDE-seq など) からの疾患コンテキストを考慮して、経路濃縮、細胞間相互作用推論、創薬可能標的の同定、免疫微小環境の特性評価、マルチモーダル統合などの包括的な生物学的解釈を実行します。 Spatial Omics Integration Score (0-100)、ドメインごとの特性評価、および検証の推奨事項を含む詳細なマークダウン レポートを作成します。 9 つの分析フェーズにわたって 70 以上の ToolUniverse ツールを使用します。ユーザーが空間トランスクリプトミクス解析、空間オミクス解釈、組織の不均一性、空間的遺伝子発現パターン、腫瘍微小環境マッピング、組織の帯状分布、または空間データからの細胞間コミュニケーションについて質問する場合に使用します。 ソース: mims-harvard/tooluniverse。

tooluniverse-spatial-omics-analysis のインストール方法は?

ターミナルまたはコマンドラインツール(Terminal、iTerm、Windows Terminal など)を開きます このコマンドをコピーして実行します: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis インストール後、スキルは自動的に AI コーディング環境に設定され、Claude Code、Cursor、OpenClaw で使用できるようになります

ソースリポジトリはどこですか?

https://github.com/mims-harvard/tooluniverse