tooluniverse-spatial-omics-analysis とは?
空間マルチオミクスデータ統合のための計算解析フレームワーク。空間可変遺伝子 (SVG)、空間ドメイン アノテーション、組織タイプ、空間トランスクリプトミクス/プロテオミクス実験 (10x Visium、MERFISH、DBiTplus、SLIDE-seq など) からの疾患コンテキストを考慮して、経路濃縮、細胞間相互作用推論、創薬可能標的の同定、免疫微小環境の特性評価、マルチモーダル統合などの包括的な生物学的解釈を実行します。 Spatial Omics Integration Score (0-100)、ドメインごとの特性評価、および検証の推奨事項を含む詳細なマークダウン レポートを作成します。 9 つの分析フェーズにわたって 70 以上の ToolUniverse ツールを使用します。ユーザーが空間トランスクリプトミクス解析、空間オミクス解釈、組織の不均一性、空間的遺伝子発現パターン、腫瘍微小環境マッピング、組織の帯状分布、または空間データからの細胞間コミュニケーションについて質問する場合に使用します。 ソース: mims-harvard/tooluniverse。