空间多组学数据集成的计算分析框架。给定来自空间转录组学/蛋白质组学实验（10x Visium、MERFISH、DBiTplus、SLIDE-seq 等）的空间可变基因 (SVG)、空间域注释、组织类型和疾病背景，执行全面的生物学解释，包括通路富集、细胞间相互作用推断、可药物靶标识别、免疫微环境表征和多模式集成。生成详细的降价报告，其中包含空间组学集成分数 (0-100)、逐个域的表征和验证建议。在 9 个分析阶段使用 70 多个 ToolUniverse 工具。当用户询问空间转录组学分析、空间组学解释、组织异质性、空间基因表达模式、肿瘤微环境绘图、组织分区或空间数据的细胞间通信时使用。
通过命令行快速安装 tooluniverse-spatial-omics-analysis AI 技能到你的开发环境
来源：mims-harvard/tooluniverse。
Comprehensive biological interpretation of spatial omics data. Transforms spatially variable genes (SVGs), domain annotations, and tissue context into actionable biological insights covering pathway enrichment, cell-cell interactions, druggable targets, immune microenvironment, and multi-modal integration.
| svgs | Yes | Spatially variable genes (gene symbols) | ['EGFR', 'CDH1', 'VIM', 'MYC', 'CD3E'] | | tissuetype | Yes | Tissue/organ type | brain, liver, lung, breast, skin | | technology | No | Spatial omics platform used | 10x Visium, MERFISH, DBiTplus, SLIDE-seq |
| diseasecontext | No | Disease if applicable | breast cancer, Alzheimer disease, liver cirrhosis | | spatialdomains | No | Dict mapping domain name to marker genes | {'Tumor core': ['MYC','EGFR'], 'Stroma': ['VIM','COL1A1']} | | celltypes | No | Cell types identified in deconvolution | ['Epithelial', 'T cell', 'Macrophage', 'Fibroblast'] |
为搜索与 AI 引用准备的稳定字段与命令。
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis空间多组学数据集成的计算分析框架。给定来自空间转录组学/蛋白质组学实验（10x Visium、MERFISH、DBiTplus、SLIDE-seq 等）的空间可变基因 (SVG)、空间域注释、组织类型和疾病背景，执行全面的生物学解释，包括通路富集、细胞间相互作用推断、可药物靶标识别、免疫微环境表征和多模式集成。生成详细的降价报告，其中包含空间组学集成分数 (0-100)、逐个域的表征和验证建议。在 9 个分析阶段使用 70 多个 ToolUniverse 工具。当用户询问空间转录组学分析、空间组学解释、组织异质性、空间基因表达模式、肿瘤微环境绘图、组织分区或空间数据的细胞间通信时使用。 来源：mims-harvard/tooluniverse。
打开你的终端或命令行工具（如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等） 复制并运行以下命令：npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis 安装完成后，技能将自动配置到你的 AI 编程环境中，可以在 Claude Code、Cursor 或 OpenClaw 中使用
https://github.com/mims-harvard/tooluniverse