·tooluniverse-spatial-omics-analysis
{}

tooluniverse-spatial-omics-analysis

إطار التحليل الحسابي لتكامل البيانات المكانية المتعددة omics. نظرًا للجينات المتغيرة مكانيًا (SVGs)، وشروح المجال المكاني، ونوع الأنسجة، وسياق المرض من تجارب النسخ المكاني/البروتينات (10x Visium، وMERFISH، وDBiTplus، وSLIDE-seq، وما إلى ذلك)، ينفذ تفسيرًا بيولوجيًا شاملاً بما في ذلك إثراء المسار، واستدلال تفاعل الخلية الخلوية، وتحديد الهدف القابل للتخدير، وتوصيف البيئة المكروية المناعية، والتكامل متعدد الوسائط. يُنتج تقريرًا مفصلاً عن تخفيض السعر مع نقاط تكامل Omics المكانية (0-100)، وتوصيف كل مجال على حدة، وتوصيات التحقق من الصحة. يستخدم أكثر من 70 أداة من أدوات ToolUniverse عبر 9 مراحل تحليل. يُستخدم عندما يسأل المستخدمون عن تحليل النسخ المكاني، أو تفسير omics المكاني، أو عدم تجانس الأنسجة، أو أنماط التعبير الجيني المكاني، أو رسم خرائط البيئة الدقيقة للورم، أو تقسيم الأنسجة، أو اتصال الخلايا الخلوية من البيانات المكانية.

96التثبيتات·3الرائج·@mims-harvard

التثبيت

$npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis

كيفية تثبيت tooluniverse-spatial-omics-analysis

ثبّت مهارة الذكاء الاصطناعي tooluniverse-spatial-omics-analysis بسرعة في بيئة التطوير لديك عبر سطر الأوامر

  1. افتح الطرفية: افتح الطرفية أو أداة سطر الأوامر لديك مثل Terminal أو iTerm أو Windows Terminal
  2. نفّذ أمر التثبيت: انسخ ونفّذ هذا الأمر: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis
  3. تحقق من التثبيت: بعد التثبيت، سيتم إعداد المهارة تلقائيا في بيئة البرمجة بالذكاء الاصطناعي لديك وتصبح جاهزة للاستخدام في Claude Code أو Cursor أو OpenClaw

المصدر: mims-harvard/tooluniverse.

Comprehensive biological interpretation of spatial omics data. Transforms spatially variable genes (SVGs), domain annotations, and tissue context into actionable biological insights covering pathway enrichment, cell-cell interactions, druggable targets, immune microenvironment, and multi-modal integration.

| svgs | Yes | Spatially variable genes (gene symbols) | ['EGFR', 'CDH1', 'VIM', 'MYC', 'CD3E'] | | tissuetype | Yes | Tissue/organ type | brain, liver, lung, breast, skin | | technology | No | Spatial omics platform used | 10x Visium, MERFISH, DBiTplus, SLIDE-seq |

| diseasecontext | No | Disease if applicable | breast cancer, Alzheimer disease, liver cirrhosis | | spatialdomains | No | Dict mapping domain name to marker genes | {'Tumor core': ['MYC','EGFR'], 'Stroma': ['VIM','COL1A1']} | | celltypes | No | Cell types identified in deconvolution | ['Epithelial', 'T cell', 'Macrophage', 'Fibroblast'] |

حقائق جاهزة للاقتباس

حقول وأوامر مستقرة للاقتباس في أنظمة الذكاء الاصطناعي والبحث.

أمر التثبيت
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis
الفئة
{}تحليل البيانات
موثق
أول ظهور
2026-02-20
آخر تحديث
2026-03-11

Browse more skills from mims-harvard/tooluniverse

إجابات سريعة

ما هي tooluniverse-spatial-omics-analysis؟

إطار التحليل الحسابي لتكامل البيانات المكانية المتعددة omics. نظرًا للجينات المتغيرة مكانيًا (SVGs)، وشروح المجال المكاني، ونوع الأنسجة، وسياق المرض من تجارب النسخ المكاني/البروتينات (10x Visium، وMERFISH، وDBiTplus، وSLIDE-seq، وما إلى ذلك)، ينفذ تفسيرًا بيولوجيًا شاملاً بما في ذلك إثراء المسار، واستدلال تفاعل الخلية الخلوية، وتحديد الهدف القابل للتخدير، وتوصيف البيئة المكروية المناعية، والتكامل متعدد الوسائط. يُنتج تقريرًا مفصلاً عن تخفيض السعر مع نقاط تكامل Omics المكانية (0-100)، وتوصيف كل مجال على حدة، وتوصيات التحقق من الصحة. يستخدم أكثر من 70 أداة من أدوات ToolUniverse عبر 9 مراحل تحليل. يُستخدم عندما يسأل المستخدمون عن تحليل النسخ المكاني، أو تفسير omics المكاني، أو عدم تجانس الأنسجة، أو أنماط التعبير الجيني المكاني، أو رسم خرائط البيئة الدقيقة للورم، أو تقسيم الأنسجة، أو اتصال الخلايا الخلوية من البيانات المكانية. المصدر: mims-harvard/tooluniverse.

كيف أثبّت tooluniverse-spatial-omics-analysis؟

افتح الطرفية أو أداة سطر الأوامر لديك مثل Terminal أو iTerm أو Windows Terminal انسخ ونفّذ هذا الأمر: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis بعد التثبيت، سيتم إعداد المهارة تلقائيا في بيئة البرمجة بالذكاء الاصطناعي لديك وتصبح جاهزة للاستخدام في Claude Code أو Cursor أو OpenClaw

أين مستودع المصدر؟

https://github.com/mims-harvard/tooluniverse