·tooluniverse-spatial-omics-analysis
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tooluniverse-spatial-omics-analysis

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mims-harvard/tooluniverseGitHub: mims-harvard/tooluniverse출처: mims-harvard/tooluniverse

공간 다중 오믹스 데이터 통합을 위한 전산 분석 프레임워크. 공간 전사체학/프로테오믹스 실험(10x Visium, MERFISH, DBiTplus, SLIDE-seq 등)의 공간 가변 유전자(SVG), 공간 도메인 주석, 조직 유형 및 질병 상황을 고려하여 경로 강화, 세포 간 상호 작용 추론, 약물 사용 가능한 표적 식별, 면역 미세 환경 특성화 및 다중 모드 통합을 포함한 포괄적인 생물학적 해석을 수행합니다. Spatial Omics 통합 점수(0-100), 도메인별 특성화 및 검증 권장 사항이 포함된 자세한 마크다운 보고서를 생성합니다. 9개 분석 단계에서 70개 이상의 ToolUniverse 도구를 사용합니다. 사용자가 공간 전사체학 분석, 공간 오믹스 해석, 조직 이질성, 공간 유전자 발현 패턴, 종양 미세환경 매핑, 조직 구역화 또는 공간 데이터의 세포-세포 통신에 대해 질문할 때 사용합니다.

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95설치·2트렌드·@mims-harvard

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GitHub: mims-harvard/tooluniverse
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tooluniverse-spatial-omics-analysis 설치 방법

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  2. 설치 명령어 실행: 이 명령어를 복사하여 실행합니다: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis
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출처: mims-harvard/tooluniverse.

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원본 보기

Comprehensive biological interpretation of spatial omics data. Transforms spatially variable genes (SVGs), domain annotations, and tissue context into actionable biological insights covering pathway enrichment, cell-cell interactions, druggable targets, immune microenvironment, and multi-modal integration.

| svgs | Yes | Spatially variable genes (gene symbols) | ['EGFR', 'CDH1', 'VIM', 'MYC', 'CD3E'] | | tissuetype | Yes | Tissue/organ type | brain, liver, lung, breast, skin | | technology | No | Spatial omics platform used | 10x Visium, MERFISH, DBiTplus, SLIDE-seq |

| diseasecontext | No | Disease if applicable | breast cancer, Alzheimer disease, liver cirrhosis | | spatialdomains | No | Dict mapping domain name to marker genes | {'Tumor core': ['MYC','EGFR'], 'Stroma': ['VIM','COL1A1']} | | celltypes | No | Cell types identified in deconvolution | ['Epithelial', 'T cell', 'Macrophage', 'Fibroblast'] |

인용 가능한 정보

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설치 명령어
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis
출처
mims-harvard/tooluniverse
카테고리
{}데이터 분석
인증됨
✓
최초 등록
2026-02-20
업데이트
2026-03-10
URL
https://www.learn-skills.dev/ko/skills/mims-harvard/tooluniverse/tooluniverse-spatial-omics-analysis

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빠른 답변

tooluniverse-spatial-omics-analysis이란?

공간 다중 오믹스 데이터 통합을 위한 전산 분석 프레임워크. 공간 전사체학/프로테오믹스 실험(10x Visium, MERFISH, DBiTplus, SLIDE-seq 등)의 공간 가변 유전자(SVG), 공간 도메인 주석, 조직 유형 및 질병 상황을 고려하여 경로 강화, 세포 간 상호 작용 추론, 약물 사용 가능한 표적 식별, 면역 미세 환경 특성화 및 다중 모드 통합을 포함한 포괄적인 생물학적 해석을 수행합니다. Spatial Omics 통합 점수(0-100), 도메인별 특성화 및 검증 권장 사항이 포함된 자세한 마크다운 보고서를 생성합니다. 9개 분석 단계에서 70개 이상의 ToolUniverse 도구를 사용합니다. 사용자가 공간 전사체학 분석, 공간 오믹스 해석, 조직 이질성, 공간 유전자 발현 패턴, 종양 미세환경 매핑, 조직 구역화 또는 공간 데이터의 세포-세포 통신에 대해 질문할 때 사용합니다. 출처: mims-harvard/tooluniverse.

tooluniverse-spatial-omics-analysis 설치 방법은?

터미널 또는 명령줄 도구(Terminal, iTerm, Windows Terminal 등)를 엽니다 이 명령어를 복사하여 실행합니다: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis 설치 후 스킬은 자동으로 AI 코딩 환경에 설정되어 Claude Code, Cursor, OpenClaw에서 사용할 수 있습니다

소스 저장소는 어디인가요?

https://github.com/mims-harvard/tooluniverse

상세

카테고리
{}데이터 분석
출처
skills.sh
최초 등록
2026-02-20

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