·tooluniverse-spatial-omics-analysis
{}

tooluniverse-spatial-omics-analysis

Marco de análisis computacional para la integración de datos multiómicos espaciales. Dados los genes espacialmente variables (SVG), las anotaciones de dominio espacial, el tipo de tejido y el contexto de la enfermedad a partir de experimentos de transcriptómica/proteómica espacial (10x Visium, MERFISH, DBiTplus, SLIDE-seq, etc.), se realiza una interpretación biológica integral que incluye enriquecimiento de vías, inferencia de interacción célula-célula, identificación de objetivos farmacológicos, caracterización del microambiente inmunológico e integración multimodal. Produce un informe de rebajas detallado con puntuación de integración de Spatial Omics (0-100), caracterización dominio por dominio y recomendaciones de validación. Utiliza más de 70 herramientas ToolUniverse en 9 fases de análisis. Úselo cuando los usuarios pregunten sobre análisis de transcriptómica espacial, interpretación de ómica espacial, heterogeneidad de tejidos, patrones de expresión de genes espaciales, mapeo de microambientes tumorales, zonificación de tejidos o comunicación entre células a partir de datos espaciales.

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Instalación

$npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis

Cómo instalar tooluniverse-spatial-omics-analysis

Instala rápidamente el skill de IA tooluniverse-spatial-omics-analysis en tu entorno de desarrollo mediante línea de comandos

  1. Abrir Terminal: Abre tu terminal o herramienta de línea de comandos (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.)
  2. Ejecutar comando de instalación: Copia y ejecuta este comando: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis
  3. Verificar instalación: Una vez instalado, el skill se configurará automáticamente en tu entorno de programación con IA y estará listo para usar en Claude Code, Cursor u OpenClaw

Fuente: mims-harvard/tooluniverse.

SKILL.md

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Comprehensive biological interpretation of spatial omics data. Transforms spatially variable genes (SVGs), domain annotations, and tissue context into actionable biological insights covering pathway enrichment, cell-cell interactions, druggable targets, immune microenvironment, and multi-modal integration.

| svgs | Yes | Spatially variable genes (gene symbols) | ['EGFR', 'CDH1', 'VIM', 'MYC', 'CD3E'] | | tissuetype | Yes | Tissue/organ type | brain, liver, lung, breast, skin | | technology | No | Spatial omics platform used | 10x Visium, MERFISH, DBiTplus, SLIDE-seq |

| diseasecontext | No | Disease if applicable | breast cancer, Alzheimer disease, liver cirrhosis | | spatialdomains | No | Dict mapping domain name to marker genes | {'Tumor core': ['MYC','EGFR'], 'Stroma': ['VIM','COL1A1']} | | celltypes | No | Cell types identified in deconvolution | ['Epithelial', 'T cell', 'Macrophage', 'Fibroblast'] |

Datos (listos para citar)

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Comando de instalación
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis
Categoría
{}Análisis de Datos
Verificado
Primera vez visto
2026-02-20
Actualizado
2026-03-10

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Respuestas rápidas

¿Qué es tooluniverse-spatial-omics-analysis?

Marco de análisis computacional para la integración de datos multiómicos espaciales. Dados los genes espacialmente variables (SVG), las anotaciones de dominio espacial, el tipo de tejido y el contexto de la enfermedad a partir de experimentos de transcriptómica/proteómica espacial (10x Visium, MERFISH, DBiTplus, SLIDE-seq, etc.), se realiza una interpretación biológica integral que incluye enriquecimiento de vías, inferencia de interacción célula-célula, identificación de objetivos farmacológicos, caracterización del microambiente inmunológico e integración multimodal. Produce un informe de rebajas detallado con puntuación de integración de Spatial Omics (0-100), caracterización dominio por dominio y recomendaciones de validación. Utiliza más de 70 herramientas ToolUniverse en 9 fases de análisis. Úselo cuando los usuarios pregunten sobre análisis de transcriptómica espacial, interpretación de ómica espacial, heterogeneidad de tejidos, patrones de expresión de genes espaciales, mapeo de microambientes tumorales, zonificación de tejidos o comunicación entre células a partir de datos espaciales. Fuente: mims-harvard/tooluniverse.

¿Cómo instalo tooluniverse-spatial-omics-analysis?

Abre tu terminal o herramienta de línea de comandos (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copia y ejecuta este comando: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-spatial-omics-analysis Una vez instalado, el skill se configurará automáticamente en tu entorno de programación con IA y estará listo para usar en Claude Code, Cursor u OpenClaw

¿Dónde está el repositorio de origen?

https://github.com/mims-harvard/tooluniverse