Qu'est-ce que tooluniverse-spatial-omics-analysis ?
Cadre d'analyse informatique pour l'intégration de données spatiales multi-omiques. Compte tenu des gènes spatialement variables (SVG), des annotations du domaine spatial, du type de tissu et du contexte de la maladie issus d'expériences de transcriptomique/protéomique spatiale (10x Visium, MERFISH, DBiTplus, SLIDE-seq, etc.), il effectue une interprétation biologique complète, y compris l'enrichissement de la voie, l'inférence d'interaction cellule-cellule, l'identification de cibles médicamenteuses, la caractérisation du microenvironnement immunitaire et l'intégration multimodale. Produit un rapport de démarque détaillé avec le score d'intégration Spatial Omics (0-100), la caractérisation domaine par domaine et les recommandations de validation. Utilise plus de 70 outils ToolUniverse sur 9 phases d’analyse. À utiliser lorsque les utilisateurs posent des questions sur l'analyse transcriptomique spatiale, l'interprétation omique spatiale, l'hétérogénéité des tissus, les modèles d'expression génique spatiale, la cartographie du microenvironnement tumoral, la zonation des tissus ou la communication cellule-cellule à partir de données spatiales. Source : mims-harvard/tooluniverse.