tooluniverse-sequence-retrieval
✓Récupère les séquences biologiques (ADN, ARN, protéines) du NCBI et de l'ENA avec la désambiguïsation des gènes, la gestion des types d'adhésion et des profils de séquence complets. Crée des rapports détaillés avec des métadonnées de séquence, des références entre bases de données et des options de téléchargement. À utiliser lorsque les utilisateurs ont besoin de séquences nucléotidiques, de séquences protéiques, de données génomiques ou de mentionner les accessions GenBank, RefSeq, EMBL.
Installation
SKILL.md
Retrieve DNA, RNA, and protein sequences with proper disambiguation and cross-database handling.
| NC | RefSeq chromosome | NCBI only | | NM | RefSeq mRNA | NCBI only | | NR | RefSeq ncRNA | NCBI only | | NP | RefSeq protein | NCBI only | | XM | RefSeq predicted mRNA | NCBI only | | U, M, K, X | GenBank | NCBI or ENA | | CP, NZ | GenBank genome | NCBI or ENA | | EMBL format | EMBL | ENA preferred |
| NCBIgetsequence | ENA (if GenBank format) | NCBI unavailable | | ENAgetentry | NCBIgetsequence | ENA doesn't have RefSeq | | NCBIsearchnucleotide | Try broader keywords | No results |
Faits (prêts à citer)
Champs et commandes stables pour les citations IA/recherche.
- Commande d'installation
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-sequence-retrieval- Catégorie
- {}Analyse de Données
- Vérifié
- ✓
- Première apparition
- 2026-02-05
- Mis à jour
- 2026-02-18
Réponses rapides
Qu'est-ce que tooluniverse-sequence-retrieval ?
Récupère les séquences biologiques (ADN, ARN, protéines) du NCBI et de l'ENA avec la désambiguïsation des gènes, la gestion des types d'adhésion et des profils de séquence complets. Crée des rapports détaillés avec des métadonnées de séquence, des références entre bases de données et des options de téléchargement. À utiliser lorsque les utilisateurs ont besoin de séquences nucléotidiques, de séquences protéiques, de données génomiques ou de mentionner les accessions GenBank, RefSeq, EMBL. Source : mims-harvard/tooluniverse.
Comment installer tooluniverse-sequence-retrieval ?
Ouvrez votre terminal ou outil de ligne de commande (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copiez et exécutez cette commande : npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-sequence-retrieval Une fois installé, le skill sera automatiquement configuré dans votre environnement de programmation IA et prêt à être utilisé dans Claude Code ou Cursor
Où se trouve le dépôt source ?
https://github.com/mims-harvard/tooluniverse
Détails
- Catégorie
- {}Analyse de Données
- Source
- skills.sh
- Première apparition
- 2026-02-05