tooluniverse-sequence-retrieval
✓遺伝子の曖昧さの除去、アクセッションタイプの処理、および包括的な配列プロファイルを使用して、NCBI および ENA から生物学的配列 (DNA、RNA、タンパク質) を取得します。シーケンスのメタデータ、データベース間の参照、ダウンロード オプションを含む詳細なレポートを作成します。ユーザーがヌクレオチド配列、タンパク質配列、ゲノムデータを必要とする場合、または GenBank、RefSeq、EMBL アクセッションについて言及する場合に使用します。
SKILL.md
Retrieve DNA, RNA, and protein sequences with proper disambiguation and cross-database handling.
| NC | RefSeq chromosome | NCBI only | | NM | RefSeq mRNA | NCBI only | | NR | RefSeq ncRNA | NCBI only | | NP | RefSeq protein | NCBI only | | XM | RefSeq predicted mRNA | NCBI only | | U, M, K, X | GenBank | NCBI or ENA | | CP, NZ | GenBank genome | NCBI or ENA | | EMBL format | EMBL | ENA preferred |
| NCBIgetsequence | ENA (if GenBank format) | NCBI unavailable | | ENAgetentry | NCBIgetsequence | ENA doesn't have RefSeq | | NCBIsearchnucleotide | Try broader keywords | No results |
引用可能な情報
AI/検索での引用用の安定したフィールドとコマンド。
- インストールコマンド
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-sequence-retrieval- カテゴリ
- {}データ分析
- 認証済み
- ✓
- 初回登録
- 2026-02-05
- 更新日
- 2026-02-18
クイックアンサー
tooluniverse-sequence-retrieval とは？
遺伝子の曖昧さの除去、アクセッションタイプの処理、および包括的な配列プロファイルを使用して、NCBI および ENA から生物学的配列 (DNA、RNA、タンパク質) を取得します。シーケンスのメタデータ、データベース間の参照、ダウンロード オプションを含む詳細なレポートを作成します。ユーザーがヌクレオチド配列、タンパク質配列、ゲノムデータを必要とする場合、または GenBank、RefSeq、EMBL アクセッションについて言及する場合に使用します。 ソース: mims-harvard/tooluniverse。
tooluniverse-sequence-retrieval のインストール方法は？
ターミナルまたはコマンドラインツール（Terminal、iTerm、Windows Terminal など）を開きます このコマンドをコピーして実行します: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-sequence-retrieval インストール後、スキルは自動的に AI コーディング環境に設定され、Claude Code や Cursor で使用できるようになります
ソースリポジトリはどこですか？
https://github.com/mims-harvard/tooluniverse