tooluniverse-literature-deep-research

SKILL.md

A systematic approach to comprehensive literature research that starts with target disambiguation to prevent missing details, uses evidence grading to separate signal from noise, and produces a content-focused report with mandatory completeness sections.

| Gene symbol (EGFR, TP53, ATP6V1A) | Biological target | Phase 1 required | | Protein name ("V-ATPase", "kinase") | Biological target | Phase 1 required | | UniProt ID (P00533, Q93050) | Biological target | Phase 1 required | | Disease, pathway, method | General topic | Phase 1 optional | | "Literature on X" | Depends on X | Assess X |

CRITICAL: This phase prevents "missing target details" when literature is sparse or noisy.

対象の明確化、証拠のグレーディング、構造化されたテーマの抽出により、包括的な文献調査を実施します。必須の完全性チェックリスト、生物学的モデルの合成、およびテスト可能な仮説を含む詳細なレポートを作成します。生物学的ターゲットの場合、文献検索の前に、公式 ID (Ensembl/UniProt)、同義語、名前の衝突を解決し、発現/経路コンテキストを収集します。デフォルトではレポートのみを出力します。必要に応じて、方法論を別の付録に記載します。ユーザーが徹底的な文献レビュー、ターゲット プロファイル、または「文献では X について何と言っているか?」を尋ねる必要がある場合に使用します。 ソース: mims-harvard/tooluniverse。

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