Realice un análisis integral de rutas y enriquecimiento de genes utilizando gseapy (ORA y GSEA), PANTHER, STRING, Reactome y más de 40 herramientas ToolUniverse. Admite enriquecimiento GO (BP, MF, CC), KEGG, Reactome, WikiPathways, MSigDB Hallmark y más de 220 bibliotecas Enrichr. Maneja múltiples tipos de identificación (símbolos genéticos, Ensembl, Entrez, UniProt), múltiples organismos (humano, ratón, rata, mosca, gusano, levadura), fondos personalizables y corrección de múltiples pruebas (BH, Bonferroni). Úselo cuando los usuarios pregunten sobre enriquecimiento de genes, análisis de vías, enriquecimiento de términos GO, análisis de vías KEGG, GSEA, análisis de sobrerrepresentación, anotación funcional o análisis de conjuntos de genes.
Instala rápidamente el skill de IA tooluniverse-gene-enrichment en tu entorno de desarrollo mediante línea de comandos
Abrir Terminal: Abre tu terminal o herramienta de línea de comandos (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.)
Ejecutar comando de instalación: Copia y ejecuta este comando: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-gene-enrichment
Verificar instalación: Una vez instalado, el skill se configurará automáticamente en tu entorno de programación con IA y estará listo para usar en Claude Code, Cursor u OpenClaw
Perform comprehensive gene enrichment analysis including Gene Ontology (GO), KEGG, Reactome, WikiPathways, and MSigDB enrichment using both Over-Representation Analysis (ORA) and Gene Set Enrichment Analysis (GSEA). Integrates local computation via gseapy with ToolUniverse pathway databases for cross-validated, publication-ready results.
IMPORTANT: Always use English terms in tool calls (gene names, pathway names, organism names), even if the user writes in another language. Only try original-language terms as a fallback if English returns no results. Respond in the user's language.
| genelist | Yes | List of gene symbols, Ensembl IDs, or Entrez IDs | ["TP53", "BRCA1", "EGFR"] | | organism | No | Organism (default: human). Supported: human, mouse, rat, fly, worm, yeast, zebrafish | human | | analysistype | No | ORA (default) or GSEA | ORA |
Datos (listos para citar)
Campos y comandos estables para citas de IA/búsqueda.
Realice un análisis integral de rutas y enriquecimiento de genes utilizando gseapy (ORA y GSEA), PANTHER, STRING, Reactome y más de 40 herramientas ToolUniverse. Admite enriquecimiento GO (BP, MF, CC), KEGG, Reactome, WikiPathways, MSigDB Hallmark y más de 220 bibliotecas Enrichr. Maneja múltiples tipos de identificación (símbolos genéticos, Ensembl, Entrez, UniProt), múltiples organismos (humano, ratón, rata, mosca, gusano, levadura), fondos personalizables y corrección de múltiples pruebas (BH, Bonferroni). Úselo cuando los usuarios pregunten sobre enriquecimiento de genes, análisis de vías, enriquecimiento de términos GO, análisis de vías KEGG, GSEA, análisis de sobrerrepresentación, anotación funcional o análisis de conjuntos de genes. Fuente: mims-harvard/tooluniverse.
¿Cómo instalo tooluniverse-gene-enrichment?
Abre tu terminal o herramienta de línea de comandos (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copia y ejecuta este comando: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-gene-enrichment Una vez instalado, el skill se configurará automáticamente en tu entorno de programación con IA y estará listo para usar en Claude Code, Cursor u OpenClaw