使用 gseapy（ORA 和 GSEA）、PANTHER、STRING、Reactome 和 40 多种 ToolUniverse 工具执行全面的基因富集和通路分析。支持 GO 富集（BP、MF、CC）、KEGG、Reactome、WikiPathways、MSigDB Hallmark 和 220 多个 Enrichr 库。处理多种 ID 类型（基因符号、Ensembl、Entrez、UniProt）、多种生物体（人类、小鼠、大鼠、苍蝇、蠕虫、酵母）、可定制背景和多重测试校正（BH、Bonferroni）。当用户询问基因富集、通路分析、GO 术语富集、KEGG 通路分析、GSEA、过度表达分析、功能注释或基因集分析时使用。
通过命令行快速安装 tooluniverse-gene-enrichment AI 技能到你的开发环境
来源：mims-harvard/tooluniverse。
Perform comprehensive gene enrichment analysis including Gene Ontology (GO), KEGG, Reactome, WikiPathways, and MSigDB enrichment using both Over-Representation Analysis (ORA) and Gene Set Enrichment Analysis (GSEA). Integrates local computation via gseapy with ToolUniverse pathway databases for cross-validated, publication-ready results.
IMPORTANT: Always use English terms in tool calls (gene names, pathway names, organism names), even if the user writes in another language. Only try original-language terms as a fallback if English returns no results. Respond in the user's language.
| genelist | Yes | List of gene symbols, Ensembl IDs, or Entrez IDs | ["TP53", "BRCA1", "EGFR"] | | organism | No | Organism (default: human). Supported: human, mouse, rat, fly, worm, yeast, zebrafish | human | | analysistype | No | ORA (default) or GSEA | ORA |
为搜索与 AI 引用准备的稳定字段与命令。
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-gene-enrichment使用 gseapy（ORA 和 GSEA）、PANTHER、STRING、Reactome 和 40 多种 ToolUniverse 工具执行全面的基因富集和通路分析。支持 GO 富集（BP、MF、CC）、KEGG、Reactome、WikiPathways、MSigDB Hallmark 和 220 多个 Enrichr 库。处理多种 ID 类型（基因符号、Ensembl、Entrez、UniProt）、多种生物体（人类、小鼠、大鼠、苍蝇、蠕虫、酵母）、可定制背景和多重测试校正（BH、Bonferroni）。当用户询问基因富集、通路分析、GO 术语富集、KEGG 通路分析、GSEA、过度表达分析、功能注释或基因集分析时使用。 来源：mims-harvard/tooluniverse。
打开你的终端或命令行工具（如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等） 复制并运行以下命令：npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-gene-enrichment 安装完成后，技能将自动配置到你的 AI 编程环境中，可以在 Claude Code、Cursor 或 OpenClaw 中使用
https://github.com/mims-harvard/tooluniverse