·tooluniverse-gene-enrichment
{}

tooluniverse-gene-enrichment

قم بإجراء تحليل شامل لإثراء الجينات وتحليل المسار باستخدام أدوات gseapy (ORA وGSEA)، وPANTHER، وSTRING، وReactome، وأكثر من 40 أداة من أدوات ToolUniverse. يدعم إثراء GO (BP، MF، CC)، KEGG، Reactome، WikiPathways، MSigDB Hallmark، وأكثر من 220 مكتبة Enrichr. يتعامل مع أنواع معرفات متعددة (رموز الجينات، Ensembl، Entrez، UniProt)، كائنات متعددة (إنسان، فأر، فأر، ذبابة، دودة، خميرة)، خلفيات قابلة للتخصيص، وتصحيح اختبار متعدد (BH، Bonferroni). يُستخدم عندما يسأل المستخدمون عن إثراء الجينات، أو تحليل المسار، أو إثراء مصطلح GO، أو تحليل مسار KEGG، أو GSEA، أو تحليل التمثيل الزائد، أو التعليق التوضيحي الوظيفي، أو تحليل مجموعة الجينات.

95التثبيتات·2الرائج·@mims-harvard

التثبيت

$npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-gene-enrichment

كيفية تثبيت tooluniverse-gene-enrichment

ثبّت مهارة الذكاء الاصطناعي tooluniverse-gene-enrichment بسرعة في بيئة التطوير لديك عبر سطر الأوامر

  1. افتح الطرفية: افتح الطرفية أو أداة سطر الأوامر لديك مثل Terminal أو iTerm أو Windows Terminal
  2. نفّذ أمر التثبيت: انسخ ونفّذ هذا الأمر: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-gene-enrichment
  3. تحقق من التثبيت: بعد التثبيت، سيتم إعداد المهارة تلقائيا في بيئة البرمجة بالذكاء الاصطناعي لديك وتصبح جاهزة للاستخدام في Claude Code أو Cursor أو OpenClaw

المصدر: mims-harvard/tooluniverse.

Perform comprehensive gene enrichment analysis including Gene Ontology (GO), KEGG, Reactome, WikiPathways, and MSigDB enrichment using both Over-Representation Analysis (ORA) and Gene Set Enrichment Analysis (GSEA). Integrates local computation via gseapy with ToolUniverse pathway databases for cross-validated, publication-ready results.

IMPORTANT: Always use English terms in tool calls (gene names, pathway names, organism names), even if the user writes in another language. Only try original-language terms as a fallback if English returns no results. Respond in the user's language.

| genelist | Yes | List of gene symbols, Ensembl IDs, or Entrez IDs | ["TP53", "BRCA1", "EGFR"] | | organism | No | Organism (default: human). Supported: human, mouse, rat, fly, worm, yeast, zebrafish | human | | analysistype | No | ORA (default) or GSEA | ORA |

حقائق جاهزة للاقتباس

حقول وأوامر مستقرة للاقتباس في أنظمة الذكاء الاصطناعي والبحث.

أمر التثبيت
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-gene-enrichment
الفئة
{}تحليل البيانات
موثق
أول ظهور
2026-02-20
آخر تحديث
2026-03-10

Browse more skills from mims-harvard/tooluniverse

إجابات سريعة

ما هي tooluniverse-gene-enrichment؟

قم بإجراء تحليل شامل لإثراء الجينات وتحليل المسار باستخدام أدوات gseapy (ORA وGSEA)، وPANTHER، وSTRING، وReactome، وأكثر من 40 أداة من أدوات ToolUniverse. يدعم إثراء GO (BP، MF، CC)، KEGG، Reactome، WikiPathways، MSigDB Hallmark، وأكثر من 220 مكتبة Enrichr. يتعامل مع أنواع معرفات متعددة (رموز الجينات، Ensembl، Entrez، UniProt)، كائنات متعددة (إنسان، فأر، فأر، ذبابة، دودة، خميرة)، خلفيات قابلة للتخصيص، وتصحيح اختبار متعدد (BH، Bonferroni). يُستخدم عندما يسأل المستخدمون عن إثراء الجينات، أو تحليل المسار، أو إثراء مصطلح GO، أو تحليل مسار KEGG، أو GSEA، أو تحليل التمثيل الزائد، أو التعليق التوضيحي الوظيفي، أو تحليل مجموعة الجينات. المصدر: mims-harvard/tooluniverse.

كيف أثبّت tooluniverse-gene-enrichment؟

افتح الطرفية أو أداة سطر الأوامر لديك مثل Terminal أو iTerm أو Windows Terminal انسخ ونفّذ هذا الأمر: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-gene-enrichment بعد التثبيت، سيتم إعداد المهارة تلقائيا في بيئة البرمجة بالذكاء الاصطناعي لديك وتصبح جاهزة للاستخدام في Claude Code أو Cursor أو OpenClaw

أين مستودع المصدر؟

https://github.com/mims-harvard/tooluniverse