gseapy(ORA 및 GSEA), PANTHER, STRING, Reactome 및 40개 이상의 ToolUniverse 도구를 사용하여 포괄적인 유전자 강화 및 경로 분석을 수행합니다. GO 강화(BP, MF, CC), KEGG, Reactome, WikiPathways, MSigDB Hallmark 및 220개 이상의 Enrichr 라이브러리를 지원합니다. 여러 ID 유형(유전자 기호, Ensembl, Entrez, UniProt), 여러 유기체(인간, 마우스, 쥐, 파리, 벌레, 효모), 사용자 정의 가능한 배경 및 여러 테스트 수정(BH, Bonferroni)을 처리합니다. 사용자가 유전자 농축, 경로 분석, GO 용어 농축, KEGG 경로 분석, GSEA, 과잉 표현 분석, 기능 주석 또는 유전자 세트 분석에 관해 질문할 때 사용합니다.
명령줄에서 tooluniverse-gene-enrichment AI 스킬을 개발 환경에 빠르게 설치
출처: mims-harvard/tooluniverse.
Perform comprehensive gene enrichment analysis including Gene Ontology (GO), KEGG, Reactome, WikiPathways, and MSigDB enrichment using both Over-Representation Analysis (ORA) and Gene Set Enrichment Analysis (GSEA). Integrates local computation via gseapy with ToolUniverse pathway databases for cross-validated, publication-ready results.
IMPORTANT: Always use English terms in tool calls (gene names, pathway names, organism names), even if the user writes in another language. Only try original-language terms as a fallback if English returns no results. Respond in the user's language.
| genelist | Yes | List of gene symbols, Ensembl IDs, or Entrez IDs | ["TP53", "BRCA1", "EGFR"] | | organism | No | Organism (default: human). Supported: human, mouse, rat, fly, worm, yeast, zebrafish | human | | analysistype | No | ORA (default) or GSEA | ORA |
AI/검색 인용용 안정적인 필드와 명령어.
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-gene-enrichmentgseapy(ORA 및 GSEA), PANTHER, STRING, Reactome 및 40개 이상의 ToolUniverse 도구를 사용하여 포괄적인 유전자 강화 및 경로 분석을 수행합니다. GO 강화(BP, MF, CC), KEGG, Reactome, WikiPathways, MSigDB Hallmark 및 220개 이상의 Enrichr 라이브러리를 지원합니다. 여러 ID 유형(유전자 기호, Ensembl, Entrez, UniProt), 여러 유기체(인간, 마우스, 쥐, 파리, 벌레, 효모), 사용자 정의 가능한 배경 및 여러 테스트 수정(BH, Bonferroni)을 처리합니다. 사용자가 유전자 농축, 경로 분석, GO 용어 농축, KEGG 경로 분석, GSEA, 과잉 표현 분석, 기능 주석 또는 유전자 세트 분석에 관해 질문할 때 사용합니다. 출처: mims-harvard/tooluniverse.
터미널 또는 명령줄 도구(Terminal, iTerm, Windows Terminal 등)를 엽니다 이 명령어를 복사하여 실행합니다: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-gene-enrichment 설치 후 스킬은 자동으로 AI 코딩 환경에 설정되어 Claude Code, Cursor, OpenClaw에서 사용할 수 있습니다
https://github.com/mims-harvard/tooluniverse