Führen Sie eine umfassende Genanreicherung und Signalweganalyse mit gseapy (ORA und GSEA), PANTHER, STRING, Reactome und über 40 ToolUniverse-Tools durch. Unterstützt GO-Anreicherung (BP, MF, CC), KEGG, Reactome, WikiPathways, MSigDB Hallmark und über 220 Enrichr-Bibliotheken. Verarbeitet mehrere ID-Typen (Gensymbole, Ensembl, Entrez, UniProt), mehrere Organismen (Mensch, Maus, Ratte, Fliege, Wurm, Hefe), anpassbare Hintergründe und mehrere Testkorrekturen (BH, Bonferroni). Verwenden Sie diese Option, wenn Benutzer nach Genanreicherung, Signalweganalyse, GO-Terminbereicherung, KEGG-Signalweganalyse, GSEA, Überrepräsentationsanalyse, funktioneller Annotation oder Gensatzanalyse fragen.
Installieren Sie den KI-Skill tooluniverse-gene-enrichment schnell in Ihrer Entwicklungsumgebung über die Kommandozeile
Terminal öffnen: Öffnen Sie Ihr Terminal oder Kommandozeilen-Tool (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.)
Installationsbefehl ausführen: Kopieren Sie diesen Befehl und führen Sie ihn aus: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-gene-enrichment
Installation überprüfen: Nach der Installation wird der Skill automatisch in Ihrer KI-Programmierumgebung konfiguriert und ist bereit zur Verwendung in Claude Code, Cursor oder OpenClaw
Perform comprehensive gene enrichment analysis including Gene Ontology (GO), KEGG, Reactome, WikiPathways, and MSigDB enrichment using both Over-Representation Analysis (ORA) and Gene Set Enrichment Analysis (GSEA). Integrates local computation via gseapy with ToolUniverse pathway databases for cross-validated, publication-ready results.
IMPORTANT: Always use English terms in tool calls (gene names, pathway names, organism names), even if the user writes in another language. Only try original-language terms as a fallback if English returns no results. Respond in the user's language.
| genelist | Yes | List of gene symbols, Ensembl IDs, or Entrez IDs | ["TP53", "BRCA1", "EGFR"] | | organism | No | Organism (default: human). Supported: human, mouse, rat, fly, worm, yeast, zebrafish | human | | analysistype | No | ORA (default) or GSEA | ORA |
Führen Sie eine umfassende Genanreicherung und Signalweganalyse mit gseapy (ORA und GSEA), PANTHER, STRING, Reactome und über 40 ToolUniverse-Tools durch. Unterstützt GO-Anreicherung (BP, MF, CC), KEGG, Reactome, WikiPathways, MSigDB Hallmark und über 220 Enrichr-Bibliotheken. Verarbeitet mehrere ID-Typen (Gensymbole, Ensembl, Entrez, UniProt), mehrere Organismen (Mensch, Maus, Ratte, Fliege, Wurm, Hefe), anpassbare Hintergründe und mehrere Testkorrekturen (BH, Bonferroni). Verwenden Sie diese Option, wenn Benutzer nach Genanreicherung, Signalweganalyse, GO-Terminbereicherung, KEGG-Signalweganalyse, GSEA, Überrepräsentationsanalyse, funktioneller Annotation oder Gensatzanalyse fragen. Quelle: mims-harvard/tooluniverse.
Wie installiere ich tooluniverse-gene-enrichment?
Öffnen Sie Ihr Terminal oder Kommandozeilen-Tool (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Kopieren Sie diesen Befehl und führen Sie ihn aus: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-gene-enrichment Nach der Installation wird der Skill automatisch in Ihrer KI-Programmierumgebung konfiguriert und ist bereit zur Verwendung in Claude Code, Cursor oder OpenClaw