Выполните комплексное обогащение генов и анализ путей с помощью gseapy (ORA и GSEA), PANTHER, STRING, Reactome и более 40 инструментов ToolUniverse. Поддерживает обогащение GO (BP, MF, CC), KEGG, Reactome, WikiPathways, MSigDB Hallmark и более 220 библиотек Enrichr. Обрабатывает несколько типов идентификаторов (генные символы, Ensembl, Entrez, UniProt), несколько организмов (человек, мышь, крыса, муха, червь, дрожжи), настраиваемый фон и коррекцию нескольких тестов (BH, Bonferroni). Используйте, когда пользователи спрашивают об обогащении генов, анализе путей, обогащении терминами GO, анализе путей KEGG, GSEA, анализе чрезмерной репрезентации, функциональной аннотации или анализе набора генов.
Быстро установите AI-навык tooluniverse-gene-enrichment в вашу среду разработки через командную строку
Откройте терминал: Откройте терминал или инструмент командной строки (Terminal, iTerm, Windows Terminal и т.д.)
Выполните команду установки: Скопируйте и выполните эту команду: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-gene-enrichment
Проверьте установку: После установки навык будет автоматически настроен в вашей AI-среде разработки и готов к использованию в Claude Code, Cursor или OpenClaw
Perform comprehensive gene enrichment analysis including Gene Ontology (GO), KEGG, Reactome, WikiPathways, and MSigDB enrichment using both Over-Representation Analysis (ORA) and Gene Set Enrichment Analysis (GSEA). Integrates local computation via gseapy with ToolUniverse pathway databases for cross-validated, publication-ready results.
IMPORTANT: Always use English terms in tool calls (gene names, pathway names, organism names), even if the user writes in another language. Only try original-language terms as a fallback if English returns no results. Respond in the user's language.
| genelist | Yes | List of gene symbols, Ensembl IDs, or Entrez IDs | ["TP53", "BRCA1", "EGFR"] | | organism | No | Organism (default: human). Supported: human, mouse, rat, fly, worm, yeast, zebrafish | human | | analysistype | No | ORA (default) or GSEA | ORA |
Выполните комплексное обогащение генов и анализ путей с помощью gseapy (ORA и GSEA), PANTHER, STRING, Reactome и более 40 инструментов ToolUniverse. Поддерживает обогащение GO (BP, MF, CC), KEGG, Reactome, WikiPathways, MSigDB Hallmark и более 220 библиотек Enrichr. Обрабатывает несколько типов идентификаторов (генные символы, Ensembl, Entrez, UniProt), несколько организмов (человек, мышь, крыса, муха, червь, дрожжи), настраиваемый фон и коррекцию нескольких тестов (BH, Bonferroni). Используйте, когда пользователи спрашивают об обогащении генов, анализе путей, обогащении терминами GO, анализе путей KEGG, GSEA, анализе чрезмерной репрезентации, функциональной аннотации или анализе набора генов. Источник: mims-harvard/tooluniverse.
Как установить tooluniverse-gene-enrichment?
Откройте терминал или инструмент командной строки (Terminal, iTerm, Windows Terminal и т.д.) Скопируйте и выполните эту команду: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-gene-enrichment После установки навык будет автоматически настроен в вашей AI-среде разработки и готов к использованию в Claude Code, Cursor или OpenClaw