·ligandmpnn
</>

ligandmpnn

✓
adaptyvbio/protein-design-skillsGitHub: adaptyvbio/protein-design-skillsИсточник: adaptyvbio/protein-design-skills

Разработка белковой последовательности с учетом лигандов с использованием LigandMPNN. Используйте этот навык, когда: (1) проектируете последовательности вокруг малых молекул, (2) проектируете активный сайт фермента, (3) оптимизируете лиганд-связывающий карман, (4) проектируете сайт координации металлов, (5) связываете белки с кофактором. Для разработки стандартного белка используйте протеинmpnn. Для оптимизации растворимости используйте solvempnn.

adaptyvbio·ligandmpnn
15Установки·0Тренд·@adaptyvbio

Установка

GitHub: adaptyvbio/protein-design-skills
$npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn

Как установить ligandmpnn

Быстро установите AI-навык ligandmpnn в вашу среду разработки через командную строку

  1. Откройте терминал: Откройте терминал или инструмент командной строки (Terminal, iTerm, Windows Terminal и т.д.)
  2. Выполните команду установки: Скопируйте и выполните эту команду: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn
  3. Проверьте установку: После установки навык будет автоматически настроен в вашей AI-среде разработки и готов к использованию в Claude Code, Cursor или OpenClaw

Источник: adaptyvbio/protein-design-skills.

SKILL.md

Показать raw

| Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 11.7+ | | GPU VRAM | 8GB | 16GB (T4) | | RAM | 8GB | 16GB |

First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.

| --pdbpath | required | path | PDB with ligand | | --numseqpertarget | 1 | 1-1000 | Sequences per structure | | --samplingtemp | "0.1" | "0.0001-1.0" | Temperature (string!) | | --ligandmpnnusesidechaincontext | true | bool | Use ligand context |

Разработка белковой последовательности с учетом лигандов с использованием LigandMPNN. Используйте этот навык, когда: (1) проектируете последовательности вокруг малых молекул, (2) проектируете активный сайт фермента, (3) оптимизируете лиганд-связывающий карман, (4) проектируете сайт координации металлов, (5) связываете белки с кофактором. Для разработки стандартного белка используйте протеинmpnn. Для оптимизации растворимости используйте solvempnn. Источник: adaptyvbio/protein-design-skills.

Факты (для цитирования)

Стабильные поля и команды для ссылок в AI/поиске.

Команда установки
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn
Источник
adaptyvbio/protein-design-skills
Категория
</>Разработка
Проверено
✓
Впервые замечено
2026-02-01
Обновлено
2026-03-10
URL
https://www.learn-skills.dev/ru/skills/adaptyvbio/protein-design-skills/ligandmpnn

Browse more skills from adaptyvbio/protein-design-skills

Короткие ответы

Что такое ligandmpnn?

Разработка белковой последовательности с учетом лигандов с использованием LigandMPNN. Используйте этот навык, когда: (1) проектируете последовательности вокруг малых молекул, (2) проектируете активный сайт фермента, (3) оптимизируете лиганд-связывающий карман, (4) проектируете сайт координации металлов, (5) связываете белки с кофактором. Для разработки стандартного белка используйте протеинmpnn. Для оптимизации растворимости используйте solvempnn. Источник: adaptyvbio/protein-design-skills.

Как установить ligandmpnn?

Откройте терминал или инструмент командной строки (Terminal, iTerm, Windows Terminal и т.д.) Скопируйте и выполните эту команду: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn После установки навык будет автоматически настроен в вашей AI-среде разработки и готов к использованию в Claude Code, Cursor или OpenClaw

Где находится исходный репозиторий?

https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills

Детали

Категория
</>Разработка
Источник
skills.sh
Впервые замечено
2026-02-01

Похожие навыки

cell-free-expression
21 Установки
binding-characterization
19 Установки
ipsae
19 Установки
protein-qc
19 Установки
campaign-manager
18 Установки
protein-design-workflow
18 Установки