ligandmpnn
✓Conception de séquences protéiques sensibles aux ligands à l'aide de LigandMPNN. Utilisez cette compétence lorsque : (1) Conception de séquences autour de petites molécules, (2) Conception de sites actifs d'enzymes, (3) Optimisation de poches de liaison de ligands, (4) Conception de sites de coordination métalliques, (5) Protéines de liaison aux cofacteurs. Pour la conception de protéines standard, utilisez proteinmpnn. Pour optimiser la solubilité, utilisez solublempnn.
Installation
SKILL.md
| Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 11.7+ | | GPU VRAM | 8GB | 16GB (T4) | | RAM | 8GB | 16GB |
First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.
| --pdbpath | required | path | PDB with ligand | | --numseqpertarget | 1 | 1-1000 | Sequences per structure | | --samplingtemp | "0.1" | "0.0001-1.0" | Temperature (string!) | | --ligandmpnnusesidechaincontext | true | bool | Use ligand context |
Conception de séquences protéiques sensibles aux ligands à l'aide de LigandMPNN. Utilisez cette compétence lorsque : (1) Conception de séquences autour de petites molécules, (2) Conception de sites actifs d'enzymes, (3) Optimisation de poches de liaison de ligands, (4) Conception de sites de coordination métalliques, (5) Protéines de liaison aux cofacteurs. Pour la conception de protéines standard, utilisez proteinmpnn. Pour optimiser la solubilité, utilisez solublempnn. Source : adaptyvbio/protein-design-skills.
Faits (prêts à citer)
Champs et commandes stables pour les citations IA/recherche.
- Commande d'installation
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn- Catégorie
- </>Développement
- Vérifié
- ✓
- Première apparition
- 2026-02-01
- Mis à jour
- 2026-02-18
Réponses rapides
Qu'est-ce que ligandmpnn ?
Conception de séquences protéiques sensibles aux ligands à l'aide de LigandMPNN. Utilisez cette compétence lorsque : (1) Conception de séquences autour de petites molécules, (2) Conception de sites actifs d'enzymes, (3) Optimisation de poches de liaison de ligands, (4) Conception de sites de coordination métalliques, (5) Protéines de liaison aux cofacteurs. Pour la conception de protéines standard, utilisez proteinmpnn. Pour optimiser la solubilité, utilisez solublempnn. Source : adaptyvbio/protein-design-skills.
Comment installer ligandmpnn ?
Ouvrez votre terminal ou outil de ligne de commande (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copiez et exécutez cette commande : npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn Une fois installé, le skill sera automatiquement configuré dans votre environnement de programmation IA et prêt à être utilisé dans Claude Code ou Cursor
Où se trouve le dépôt source ?
https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills
Détails
- Catégorie
- </>Développement
- Source
- skills.sh
- Première apparition
- 2026-02-01