ligandmpnn
✓使用 LigandMPNN 进行配体感知蛋白质序列设计。在以下情况下使用此技能:(1) 设计小分子周围的序列,(2) 酶活性位点设计,(3) 配体结合袋优化,(4) 金属配位位点设计,(5) 辅因子结合蛋白。 对于标准蛋白质设计,请使用 Proteinmpnn。对于溶解度优化,请使用可溶性mpnn。
SKILL.md
| Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 11.7+ | | GPU VRAM | 8GB | 16GB (T4) | | RAM | 8GB | 16GB |
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| --pdbpath | required | path | PDB with ligand | | --numseqpertarget | 1 | 1-1000 | Sequences per structure | | --samplingtemp | "0.1" | "0.0001-1.0" | Temperature (string!) | | --ligandmpnnusesidechaincontext | true | bool | Use ligand context |
使用 LigandMPNN 进行配体感知蛋白质序列设计。在以下情况下使用此技能:(1) 设计小分子周围的序列,(2) 酶活性位点设计,(3) 配体结合袋优化,(4) 金属配位位点设计,(5) 辅因子结合蛋白。 对于标准蛋白质设计,请使用 Proteinmpnn。对于溶解度优化,请使用可溶性mpnn。 来源:adaptyvbio/protein-design-skills。
可引用信息
为搜索与 AI 引用准备的稳定字段与命令。
- 安装命令
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn- 分类
- </>开发工具
- 认证
- ✓
- 收录时间
- 2026-02-01
- 更新时间
- 2026-02-18
快速解答
什么是 ligandmpnn?
使用 LigandMPNN 进行配体感知蛋白质序列设计。在以下情况下使用此技能:(1) 设计小分子周围的序列,(2) 酶活性位点设计,(3) 配体结合袋优化,(4) 金属配位位点设计,(5) 辅因子结合蛋白。 对于标准蛋白质设计,请使用 Proteinmpnn。对于溶解度优化,请使用可溶性mpnn。 来源:adaptyvbio/protein-design-skills。
如何安装 ligandmpnn?
打开你的终端或命令行工具(如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等) 复制并运行以下命令:npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn 安装完成后,技能将自动配置到你的 AI 编程环境中,可以在 Claude Code 或 Cursor 中使用
这个 Skill 的源码在哪?
https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills
详情
- 分类
- </>开发工具
- 来源
- skills.sh
- 收录时间
- 2026-02-01