·alphafold

使用 AlphaFold2 结构预测验证蛋白质设计。在以下情况下使用此技能:(1) 验证设计的序列折叠是否正确,(2) 预测结合物-靶标复杂结构,(3) 计算置信度指标(pLDDT、pTM、ipTM),(4) 设计的自一致性验证,(5) 使用 AlphaFold-Multimer 进行多链复杂预测。 为了更快地进行单链预测,请使用 esm。对于 QC 阈值,请使用 Protein-qc。

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安装

$npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill alphafold

SKILL.md

| Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 12.0+ | | GPU VRAM | 32GB | 40GB (A100) | | RAM | 32GB | 64GB | | Disk | 100GB | 500GB (for databases) |

First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.

| --modelpreset | monomer | monomer/multimer | Model type | | --numrecycle | 3 | 1-20 | Recycling iterations | | --maxtemplatedate | - | YYYY-MM-DD | Template cutoff | | --usetemplates | True | True/False | Use template search |

使用 AlphaFold2 结构预测验证蛋白质设计。在以下情况下使用此技能:(1) 验证设计的序列折叠是否正确,(2) 预测结合物-靶标复杂结构,(3) 计算置信度指标(pLDDT、pTM、ipTM),(4) 设计的自一致性验证,(5) 使用 AlphaFold-Multimer 进行多链复杂预测。 为了更快地进行单链预测,请使用 esm。对于 QC 阈值,请使用 Protein-qc。 来源:adaptyvbio/protein-design-skills。

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可引用信息

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安装命令
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill alphafold
分类
</>开发工具
认证
收录时间
2026-02-01
更新时间
2026-02-18

快速解答

什么是 alphafold?

使用 AlphaFold2 结构预测验证蛋白质设计。在以下情况下使用此技能:(1) 验证设计的序列折叠是否正确,(2) 预测结合物-靶标复杂结构,(3) 计算置信度指标(pLDDT、pTM、ipTM),(4) 设计的自一致性验证,(5) 使用 AlphaFold-Multimer 进行多链复杂预测。 为了更快地进行单链预测,请使用 esm。对于 QC 阈值,请使用 Protein-qc。 来源:adaptyvbio/protein-design-skills。

如何安装 alphafold?

打开你的终端或命令行工具(如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等) 复制并运行以下命令:npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill alphafold 安装完成后,技能将自动配置到你的 AI 编程环境中,可以在 Claude Code 或 Cursor 中使用

这个 Skill 的源码在哪?

https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills