·alphafold

使用 AlphaFold2 結構預測驗證蛋白質設計。在以下情況下使用此技能:(1) 驗證設計的序列折疊是否正確,(2) 預測結合物-靶標複雜結構,(3) 計算置信度指標(pLDDT、pTM、ipTM),(4) 設計的自一致性驗證,(5) 使用 AlphaFold-Multimer 進行多鏈複雜預測。 為了更快地進行單鏈預測,請使用 esm。對於 QC 閾值,請使用 Protein-qc。

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安裝

$npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill alphafold

SKILL.md

| Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 12.0+ | | GPU VRAM | 32GB | 40GB (A100) | | RAM | 32GB | 64GB | | Disk | 100GB | 500GB (for databases) |

First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.

| --modelpreset | monomer | monomer/multimer | Model type | | --numrecycle | 3 | 1-20 | Recycling iterations | | --maxtemplatedate | - | YYYY-MM-DD | Template cutoff | | --usetemplates | True | True/False | Use template search |

使用 AlphaFold2 結構預測驗證蛋白質設計。在以下情況下使用此技能:(1) 驗證設計的序列折疊是否正確,(2) 預測結合物-靶標複雜結構,(3) 計算置信度指標(pLDDT、pTM、ipTM),(4) 設計的自一致性驗證,(5) 使用 AlphaFold-Multimer 進行多鏈複雜預測。 為了更快地進行單鏈預測,請使用 esm。對於 QC 閾值,請使用 Protein-qc。 來源:adaptyvbio/protein-design-skills。

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可引用資訊

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安裝指令
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill alphafold
分類
</>開發工具
認證
收錄時間
2026-02-01
更新時間
2026-02-18

快速解答

什麼是 alphafold?

使用 AlphaFold2 結構預測驗證蛋白質設計。在以下情況下使用此技能:(1) 驗證設計的序列折疊是否正確,(2) 預測結合物-靶標複雜結構,(3) 計算置信度指標(pLDDT、pTM、ipTM),(4) 設計的自一致性驗證,(5) 使用 AlphaFold-Multimer 進行多鏈複雜預測。 為了更快地進行單鏈預測,請使用 esm。對於 QC 閾值,請使用 Protein-qc。 來源:adaptyvbio/protein-design-skills。

如何安裝 alphafold?

開啟你的終端機或命令列工具(如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等) 複製並執行以下指令:npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill alphafold 安裝完成後,技能將自動設定到你的 AI 程式設計環境中,可以在 Claude Code 或 Cursor 中使用

這個 Skill 的原始碼在哪?

https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills