ligandmpnn
✓Diseño de secuencia de proteínas compatible con ligandos utilizando LigandMPNN. Utilice esta habilidad cuando: (1) Diseñe secuencias alrededor de moléculas pequeñas, (2) Diseño de sitios activos enzimáticos, (3) Optimización del bolsillo de unión de ligandos, (4) Diseño de sitios de coordinación de metales, (5) Proteínas de unión a cofactores. Para el diseño de proteínas estándar, utilice proteinmpnn. Para optimizar la solubilidad, utilice solublempnn.
Instalación
SKILL.md
| Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 11.7+ | | GPU VRAM | 8GB | 16GB (T4) | | RAM | 8GB | 16GB |
First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.
| --pdbpath | required | path | PDB with ligand | | --numseqpertarget | 1 | 1-1000 | Sequences per structure | | --samplingtemp | "0.1" | "0.0001-1.0" | Temperature (string!) | | --ligandmpnnusesidechaincontext | true | bool | Use ligand context |
Diseño de secuencia de proteínas compatible con ligandos utilizando LigandMPNN. Utilice esta habilidad cuando: (1) Diseñe secuencias alrededor de moléculas pequeñas, (2) Diseño de sitios activos enzimáticos, (3) Optimización del bolsillo de unión de ligandos, (4) Diseño de sitios de coordinación de metales, (5) Proteínas de unión a cofactores. Para el diseño de proteínas estándar, utilice proteinmpnn. Para optimizar la solubilidad, utilice solublempnn. Fuente: adaptyvbio/protein-design-skills.
Datos (listos para citar)
Campos y comandos estables para citas de IA/búsqueda.
- Comando de instalación
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn- Categoría
- </>Desarrollo
- Verificado
- ✓
- Primera vez visto
- 2026-02-01
- Actualizado
- 2026-02-18
Respuestas rápidas
¿Qué es ligandmpnn?
Diseño de secuencia de proteínas compatible con ligandos utilizando LigandMPNN. Utilice esta habilidad cuando: (1) Diseñe secuencias alrededor de moléculas pequeñas, (2) Diseño de sitios activos enzimáticos, (3) Optimización del bolsillo de unión de ligandos, (4) Diseño de sitios de coordinación de metales, (5) Proteínas de unión a cofactores. Para el diseño de proteínas estándar, utilice proteinmpnn. Para optimizar la solubilidad, utilice solublempnn. Fuente: adaptyvbio/protein-design-skills.
¿Cómo instalo ligandmpnn?
Abre tu terminal o herramienta de línea de comandos (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copia y ejecuta este comando: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn Una vez instalado, el skill se configurará automáticamente en tu entorno de programación con IA y estará listo para usar en Claude Code o Cursor
¿Dónde está el repositorio de origen?
https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills
Detalles
- Categoría
- </>Desarrollo
- Fuente
- skills.sh
- Primera vez visto
- 2026-02-01