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ligandmpnn

adaptyvbio/protein-design-skills

Ligandenbewusstes Proteinsequenzdesign mit LigandMPNN. Verwenden Sie diese Fähigkeit, wenn: (1) Sequenzen um kleine Moleküle herum entworfen werden, (2) das aktive Zentrum von Enzymen, (3) die Ligandenbindungstasche optimiert wird, (4) das Design von Metallkoordinationsstellen, (5) Cofaktor-bindende Proteine. Verwenden Sie für das Standard-Proteindesign proteinmpnn. Verwenden Sie zur Optimierung der Löslichkeit solviblempnn.

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Installation

$npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn

SKILL.md

| Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 11.7+ | | GPU VRAM | 8GB | 16GB (T4) | | RAM | 8GB | 16GB |

First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.

| --pdbpath | required | path | PDB with ligand | | --numseqpertarget | 1 | 1-1000 | Sequences per structure | | --samplingtemp | "0.1" | "0.0001-1.0" | Temperature (string!) | | --ligandmpnnusesidechaincontext | true | bool | Use ligand context |

Ligandenbewusstes Proteinsequenzdesign mit LigandMPNN. Verwenden Sie diese Fähigkeit, wenn: (1) Sequenzen um kleine Moleküle herum entworfen werden, (2) das aktive Zentrum von Enzymen, (3) die Ligandenbindungstasche optimiert wird, (4) das Design von Metallkoordinationsstellen, (5) Cofaktor-bindende Proteine. Verwenden Sie für das Standard-Proteindesign proteinmpnn. Verwenden Sie zur Optimierung der Löslichkeit solviblempnn. Quelle: adaptyvbio/protein-design-skills.

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Fakten (zitierbereit)

Stabile Felder und Befehle für KI/Such-Zitate.

Installationsbefehl
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn
Kategorie
</>Entwicklung
Verifiziert
Erstes Auftreten
2026-02-01
Aktualisiert
2026-02-18

Schnelle Antworten

Was ist ligandmpnn?

Ligandenbewusstes Proteinsequenzdesign mit LigandMPNN. Verwenden Sie diese Fähigkeit, wenn: (1) Sequenzen um kleine Moleküle herum entworfen werden, (2) das aktive Zentrum von Enzymen, (3) die Ligandenbindungstasche optimiert wird, (4) das Design von Metallkoordinationsstellen, (5) Cofaktor-bindende Proteine. Verwenden Sie für das Standard-Proteindesign proteinmpnn. Verwenden Sie zur Optimierung der Löslichkeit solviblempnn. Quelle: adaptyvbio/protein-design-skills.

Wie installiere ich ligandmpnn?

Öffnen Sie Ihr Terminal oder Kommandozeilen-Tool (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Kopieren Sie diesen Befehl und führen Sie ihn aus: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn Nach der Installation wird der Skill automatisch in Ihrer KI-Programmierumgebung konfiguriert und ist bereit zur Verwendung in Claude Code oder Cursor

Wo ist das Quell-Repository?

https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills