ligandmpnn
✓LigandMPNN を使用したリガンド認識タンパク質配列設計。このスキルは、(1) 低分子周囲の配列の設計、(2) 酵素活性部位の設計、(3) リガンド結合ポケットの最適化、(4) 金属配位部位の設計、(5) 補因子結合タンパク質の場合に使用します。 標準的なタンパク質設計の場合は、proteinmpnn を使用します。溶解度の最適化には、solublicmpnn を使用します。
SKILL.md
| Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 11.7+ | | GPU VRAM | 8GB | 16GB (T4) | | RAM | 8GB | 16GB |
First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.
| --pdbpath | required | path | PDB with ligand | | --numseqpertarget | 1 | 1-1000 | Sequences per structure | | --samplingtemp | "0.1" | "0.0001-1.0" | Temperature (string!) | | --ligandmpnnusesidechaincontext | true | bool | Use ligand context |
LigandMPNN を使用したリガンド認識タンパク質配列設計。このスキルは、(1) 低分子周囲の配列の設計、(2) 酵素活性部位の設計、(3) リガンド結合ポケットの最適化、(4) 金属配位部位の設計、(5) 補因子結合タンパク質の場合に使用します。 標準的なタンパク質設計の場合は、proteinmpnn を使用します。溶解度の最適化には、solublicmpnn を使用します。 ソース: adaptyvbio/protein-design-skills。
引用可能な情報
AI/検索での引用用の安定したフィールドとコマンド。
- インストールコマンド
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn- カテゴリ
- </>開発ツール
- 認証済み
- ✓
- 初回登録
- 2026-02-01
- 更新日
- 2026-02-18
クイックアンサー
ligandmpnn とは？
LigandMPNN を使用したリガンド認識タンパク質配列設計。このスキルは、(1) 低分子周囲の配列の設計、(2) 酵素活性部位の設計、(3) リガンド結合ポケットの最適化、(4) 金属配位部位の設計、(5) 補因子結合タンパク質の場合に使用します。 標準的なタンパク質設計の場合は、proteinmpnn を使用します。溶解度の最適化には、solublicmpnn を使用します。 ソース: adaptyvbio/protein-design-skills。
ligandmpnn のインストール方法は？
ターミナルまたはコマンドラインツール（Terminal、iTerm、Windows Terminal など）を開きます このコマンドをコピーして実行します: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn インストール後、スキルは自動的に AI コーディング環境に設定され、Claude Code や Cursor で使用できるようになります
ソースリポジトリはどこですか？
https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills
詳細
- カテゴリ
- </>開発ツール
- ソース
- skills.sh
- 初回登録
- 2026-02-01