·ipsae
</>

ipsae

✓
adaptyvbio/protein-design-skillsGitHub: adaptyvbio/protein-design-skillsИсточник: adaptyvbio/protein-design-skills

Рейтинг дизайна Binder с использованием ipSAE (межбелковая оценка на основе согласованных ошибок). Используйте этот навык, когда: (1) ранжируете проекты связующих для экспериментального тестирования, (2) фильтруете выходные данные BindCraft или RFdiffusion, (3) сравниваете прогнозы AF2/AF3/Boltz, (4) прогнозируете процент успешных связываний, (5) требуется более высокий рейтинг, чем ipTM или iPAE. Для прогнозирования структуры используйте chai или Alphafold. Для порогов контроля качества используйте белок-QC.

adaptyvbio·ipsae
19Установки·0Тренд·@adaptyvbio

Установка

GitHub: adaptyvbio/protein-design-skills
$npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ipsae

Как установить ipsae

Быстро установите AI-навык ipsae в вашу среду разработки через командную строку

  1. Откройте терминал: Откройте терминал или инструмент командной строки (Terminal, iTerm, Windows Terminal и т.д.)
  2. Выполните команду установки: Скопируйте и выполните эту команду: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ipsae
  3. Проверьте установку: После установки навык будет автоматически настроен в вашей AI-среде разработки и готов к использованию в Claude Code, Cursor или OpenClaw

Источник: adaptyvbio/protein-design-skills.

SKILL.md

Показать raw

| Python | 3.8+ | 3.10 | | NumPy | 1.20+ | Latest | | RAM | 8GB | 16GB |

ipSAE (interprotein Score from Aligned Errors) is a scoring function for ranking protein-protein interactions predicted by AlphaFold2, AlphaFold3, and Boltz1. It outperforms ipTM and iPAE for binder design ranking with 1.4x higher precision in identifying true binders.

| PAE file | JSON (AF2/AF3) or NPZ (Boltz) | Match predictor | | Structure file | PDB or CIF structure | Match PAE | | PAE cutoff | Threshold for contacts | 10-15 | | Distance cutoff | Max CA-CA distance (A) | 10-15 |

Рейтинг дизайна Binder с использованием ipSAE (межбелковая оценка на основе согласованных ошибок). Используйте этот навык, когда: (1) ранжируете проекты связующих для экспериментального тестирования, (2) фильтруете выходные данные BindCraft или RFdiffusion, (3) сравниваете прогнозы AF2/AF3/Boltz, (4) прогнозируете процент успешных связываний, (5) требуется более высокий рейтинг, чем ipTM или iPAE. Для прогнозирования структуры используйте chai или Alphafold. Для порогов контроля качества используйте белок-QC. Источник: adaptyvbio/protein-design-skills.

Факты (для цитирования)

Стабильные поля и команды для ссылок в AI/поиске.

Команда установки
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ipsae
Источник
adaptyvbio/protein-design-skills
Категория
</>Разработка
Проверено
✓
Впервые замечено
2026-02-01
Обновлено
2026-03-10
URL
https://www.learn-skills.dev/ru/skills/adaptyvbio/protein-design-skills/ipsae

Browse more skills from adaptyvbio/protein-design-skills

Короткие ответы

Что такое ipsae?

Рейтинг дизайна Binder с использованием ipSAE (межбелковая оценка на основе согласованных ошибок). Используйте этот навык, когда: (1) ранжируете проекты связующих для экспериментального тестирования, (2) фильтруете выходные данные BindCraft или RFdiffusion, (3) сравниваете прогнозы AF2/AF3/Boltz, (4) прогнозируете процент успешных связываний, (5) требуется более высокий рейтинг, чем ipTM или iPAE. Для прогнозирования структуры используйте chai или Alphafold. Для порогов контроля качества используйте белок-QC. Источник: adaptyvbio/protein-design-skills.

Как установить ipsae?

Откройте терминал или инструмент командной строки (Terminal, iTerm, Windows Terminal и т.д.) Скопируйте и выполните эту команду: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ipsae После установки навык будет автоматически настроен в вашей AI-среде разработки и готов к использованию в Claude Code, Cursor или OpenClaw

Где находится исходный репозиторий?

https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills

Детали

Категория
</>Разработка
Источник
skills.sh
Впервые замечено
2026-02-01

Похожие навыки

cell-free-expression
21 Установки
binding-characterization
19 Установки
protein-qc
19 Установки
campaign-manager
18 Установки
protein-design-workflow
18 Установки
binder-design
18 Установки