ipsae
✓ipSAE(Aligned Errors의 단백질 간 점수)를 사용한 바인더 디자인 순위. (1) 실험 테스트를 위한 바인더 디자인 순위 지정, (2) BindCraft 또는 RFdiffusion 출력 필터링, (3) AF2/AF3/Boltz 예측 비교, (4) 바인딩 성공률 예측, (5) ipTM 또는 iPAE보다 더 나은 순위가 필요한 경우 이 기술을 사용하십시오. 구조 예측에는 chai 또는 alphafold를 사용합니다. QC 임계값의 경우 Protein-qc를 사용하세요.
SKILL.md
| Python | 3.8+ | 3.10 | | NumPy | 1.20+ | Latest | | RAM | 8GB | 16GB |
ipSAE (interprotein Score from Aligned Errors) is a scoring function for ranking protein-protein interactions predicted by AlphaFold2, AlphaFold3, and Boltz1. It outperforms ipTM and iPAE for binder design ranking with 1.4x higher precision in identifying true binders.
| PAE file | JSON (AF2/AF3) or NPZ (Boltz) | Match predictor | | Structure file | PDB or CIF structure | Match PAE | | PAE cutoff | Threshold for contacts | 10-15 | | Distance cutoff | Max CA-CA distance (A) | 10-15 |
ipSAE(Aligned Errors의 단백질 간 점수)를 사용한 바인더 디자인 순위. (1) 실험 테스트를 위한 바인더 디자인 순위 지정, (2) BindCraft 또는 RFdiffusion 출력 필터링, (3) AF2/AF3/Boltz 예측 비교, (4) 바인딩 성공률 예측, (5) ipTM 또는 iPAE보다 더 나은 순위가 필요한 경우 이 기술을 사용하십시오. 구조 예측에는 chai 또는 alphafold를 사용합니다. QC 임계값의 경우 Protein-qc를 사용하세요. 출처: adaptyvbio/protein-design-skills.
인용 가능한 정보
AI/검색 인용용 안정적인 필드와 명령어.
- 설치 명령어
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ipsae- 카테고리
- </>개발 도구
- 인증됨
- ✓
- 최초 등록
- 2026-02-01
- 업데이트
- 2026-02-18
빠른 답변
ipsae이란?
ipSAE(Aligned Errors의 단백질 간 점수)를 사용한 바인더 디자인 순위. (1) 실험 테스트를 위한 바인더 디자인 순위 지정, (2) BindCraft 또는 RFdiffusion 출력 필터링, (3) AF2/AF3/Boltz 예측 비교, (4) 바인딩 성공률 예측, (5) ipTM 또는 iPAE보다 더 나은 순위가 필요한 경우 이 기술을 사용하십시오. 구조 예측에는 chai 또는 alphafold를 사용합니다. QC 임계값의 경우 Protein-qc를 사용하세요. 출처: adaptyvbio/protein-design-skills.
ipsae 설치 방법은?
터미널 또는 명령줄 도구(Terminal, iTerm, Windows Terminal 등)를 엽니다 이 명령어를 복사하여 실행합니다: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ipsae 설치 후 스킬은 자동으로 AI 코딩 환경에 설정되어 Claude Code나 Cursor에서 사용할 수 있습니다
소스 저장소는 어디인가요?
https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills
상세
- 카테고리
- </>개발 도구
- 출처
- skills.sh
- 최초 등록
- 2026-02-01