·ligandmpnn
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ligandmpnn

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adaptyvbio/protein-design-skillsGitHub: adaptyvbio/protein-design-skillsFonte: adaptyvbio/protein-design-skills

Progettazione di sequenze proteiche sensibili al ligando utilizzando LigandMPNN. Utilizzare questa abilità quando: (1) Progettare sequenze attorno a piccole molecole, (2) Progettare il sito attivo dell'enzima, (3) Ottimizzare la tasca di legame del ligando, (4) Progettare il sito di coordinazione del metallo, (5) Proteine ​​leganti il ​​cofattore. Per la progettazione di proteine ​​standard, utilizzare proteinmpnn. Per l'ottimizzazione della solubilità, utilizzare solubilimpnn.

adaptyvbio·ligandmpnn
15Installazioni·0Tendenza·@adaptyvbio

Installazione

GitHub: adaptyvbio/protein-design-skills
$npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn

Come installare ligandmpnn

Installa rapidamente la skill AI ligandmpnn nel tuo ambiente di sviluppo tramite riga di comando

  1. Apri il terminale: Apri il tuo terminale o strumento da riga di comando (Terminal, iTerm, Windows Terminal, ecc.)
  2. Esegui il comando di installazione: Copia ed esegui questo comando: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn
  3. Verifica l'installazione: Dopo l'installazione, la skill verrà configurata automaticamente nel tuo ambiente AI di coding e sarà pronta all'uso in Claude Code, Cursor o OpenClaw

Fonte: adaptyvbio/protein-design-skills.

SKILL.md

Visualizza raw

| Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 11.7+ | | GPU VRAM | 8GB | 16GB (T4) | | RAM | 8GB | 16GB |

First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.

| --pdbpath | required | path | PDB with ligand | | --numseqpertarget | 1 | 1-1000 | Sequences per structure | | --samplingtemp | "0.1" | "0.0001-1.0" | Temperature (string!) | | --ligandmpnnusesidechaincontext | true | bool | Use ligand context |

Progettazione di sequenze proteiche sensibili al ligando utilizzando LigandMPNN. Utilizzare questa abilità quando: (1) Progettare sequenze attorno a piccole molecole, (2) Progettare il sito attivo dell'enzima, (3) Ottimizzare la tasca di legame del ligando, (4) Progettare il sito di coordinazione del metallo, (5) Proteine ​​leganti il ​​cofattore. Per la progettazione di proteine ​​standard, utilizzare proteinmpnn. Per l'ottimizzazione della solubilità, utilizzare solubilimpnn. Fonte: adaptyvbio/protein-design-skills.

Fatti (pronti per citazione)

Campi e comandi stabili per citazioni AI/ricerca.

Comando di installazione
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn
Fonte
adaptyvbio/protein-design-skills
Categoria
</>Sviluppo
Verificato
✓
Prima apparizione
2026-02-01
Aggiornato
2026-03-10
URL
https://www.learn-skills.dev/it/skills/adaptyvbio/protein-design-skills/ligandmpnn

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Risposte rapide

Che cos'è ligandmpnn?

Progettazione di sequenze proteiche sensibili al ligando utilizzando LigandMPNN. Utilizzare questa abilità quando: (1) Progettare sequenze attorno a piccole molecole, (2) Progettare il sito attivo dell'enzima, (3) Ottimizzare la tasca di legame del ligando, (4) Progettare il sito di coordinazione del metallo, (5) Proteine ​​leganti il ​​cofattore. Per la progettazione di proteine ​​standard, utilizzare proteinmpnn. Per l'ottimizzazione della solubilità, utilizzare solubilimpnn. Fonte: adaptyvbio/protein-design-skills.

Come installo ligandmpnn?

Apri il tuo terminale o strumento da riga di comando (Terminal, iTerm, Windows Terminal, ecc.) Copia ed esegui questo comando: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill ligandmpnn Dopo l'installazione, la skill verrà configurata automaticamente nel tuo ambiente AI di coding e sarà pronta all'uso in Claude Code, Cursor o OpenClaw

Dov'è il repository sorgente?

https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills

Dettagli

Categoria
</>Sviluppo
Fonte
skills.sh
Prima apparizione
2026-02-01

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