foldseek
✓Foldseek을 이용한 구조 유사성 검색. (1) PDB/AFDB 데이터베이스에서 유사한 구조 찾기, (2) 구조적 상동성 검색, (3) 3D 구조로 데이터베이스 쿼리, (4) 시퀀스로 감지되지 않은 원격 상동체 찾기, (5) 유사성을 기준으로 구조 클러스터링. 서열 유사성을 위해서는 uniprot BLAST를 사용하십시오. 구조 예측에는 chai 또는 boltz를 사용합니다.
SKILL.md
| Python | 3.8+ | 3.10 | | RAM | 8GB | 16GB | | Disk | 10GB | 50GB (for local databases) |
Note: Foldseek can run locally or via web server. No GPU required.
| --min-seq-id | 0.0 | Minimum sequence identity | | -e | 0.001 | E-value threshold | | --alignment-type | 2 | 0=3Di, 1=TM, 2=3Di+AA | | --max-seqs | 300 | Max hits to pass through prefilter; reducing this affects sensitivity |
Foldseek을 이용한 구조 유사성 검색. (1) PDB/AFDB 데이터베이스에서 유사한 구조 찾기, (2) 구조적 상동성 검색, (3) 3D 구조로 데이터베이스 쿼리, (4) 시퀀스로 감지되지 않은 원격 상동체 찾기, (5) 유사성을 기준으로 구조 클러스터링. 서열 유사성을 위해서는 uniprot BLAST를 사용하십시오. 구조 예측에는 chai 또는 boltz를 사용합니다. 출처: adaptyvbio/protein-design-skills.
인용 가능한 정보
AI/검색 인용용 안정적인 필드와 명령어.
- 설치 명령어
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill foldseek- 카테고리
- </>개발 도구
- 인증됨
- ✓
- 최초 등록
- 2026-02-01
- 업데이트
- 2026-02-18
빠른 답변
foldseek이란?
Foldseek을 이용한 구조 유사성 검색. (1) PDB/AFDB 데이터베이스에서 유사한 구조 찾기, (2) 구조적 상동성 검색, (3) 3D 구조로 데이터베이스 쿼리, (4) 시퀀스로 감지되지 않은 원격 상동체 찾기, (5) 유사성을 기준으로 구조 클러스터링. 서열 유사성을 위해서는 uniprot BLAST를 사용하십시오. 구조 예측에는 chai 또는 boltz를 사용합니다. 출처: adaptyvbio/protein-design-skills.
foldseek 설치 방법은?
터미널 또는 명령줄 도구(Terminal, iTerm, Windows Terminal 등)를 엽니다 이 명령어를 복사하여 실행합니다: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill foldseek 설치 후 스킬은 자동으로 AI 코딩 환경에 설정되어 Claude Code나 Cursor에서 사용할 수 있습니다
소스 저장소는 어디인가요?
https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills
상세
- 카테고리
- </>개발 도구
- 출처
- skills.sh
- 최초 등록
- 2026-02-01