foldseek
✓Búsqueda de similitudes de estructuras con Foldseek. Utilice esta habilidad cuando: (1) encuentre estructuras similares en bases de datos PDB/AFDB, (2) busqueda de homología estructural, (3) consulte bases de datos por estructura 3D, (4) encuentre homólogos remotos no detectados por secuencia, (5) agrupe estructuras por similitud. Para similitud de secuencia, utilice uniprot BLAST. Para la predicción de estructuras, utilice chai o Boltz.
Instalación
SKILL.md
| Python | 3.8+ | 3.10 | | RAM | 8GB | 16GB | | Disk | 10GB | 50GB (for local databases) |
Note: Foldseek can run locally or via web server. No GPU required.
| --min-seq-id | 0.0 | Minimum sequence identity | | -e | 0.001 | E-value threshold | | --alignment-type | 2 | 0=3Di, 1=TM, 2=3Di+AA | | --max-seqs | 300 | Max hits to pass through prefilter; reducing this affects sensitivity |
Búsqueda de similitudes de estructuras con Foldseek. Utilice esta habilidad cuando: (1) encuentre estructuras similares en bases de datos PDB/AFDB, (2) busqueda de homología estructural, (3) consulte bases de datos por estructura 3D, (4) encuentre homólogos remotos no detectados por secuencia, (5) agrupe estructuras por similitud. Para similitud de secuencia, utilice uniprot BLAST. Para la predicción de estructuras, utilice chai o Boltz. Fuente: adaptyvbio/protein-design-skills.
Datos (listos para citar)
Campos y comandos estables para citas de IA/búsqueda.
- Comando de instalación
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill foldseek- Categoría
- </>Desarrollo
- Verificado
- ✓
- Primera vez visto
- 2026-02-01
- Actualizado
- 2026-02-18
Respuestas rápidas
¿Qué es foldseek?
Búsqueda de similitudes de estructuras con Foldseek. Utilice esta habilidad cuando: (1) encuentre estructuras similares en bases de datos PDB/AFDB, (2) busqueda de homología estructural, (3) consulte bases de datos por estructura 3D, (4) encuentre homólogos remotos no detectados por secuencia, (5) agrupe estructuras por similitud. Para similitud de secuencia, utilice uniprot BLAST. Para la predicción de estructuras, utilice chai o Boltz. Fuente: adaptyvbio/protein-design-skills.
¿Cómo instalo foldseek?
Abre tu terminal o herramienta de línea de comandos (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copia y ejecuta este comando: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill foldseek Una vez instalado, el skill se configurará automáticamente en tu entorno de programación con IA y estará listo para usar en Claude Code o Cursor
¿Dónde está el repositorio de origen?
https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills
Detalles
- Categoría
- </>Desarrollo
- Fuente
- skills.sh
- Primera vez visto
- 2026-02-01