rdkit とは？
分子操作と分析のための Python ケモインフォマティクス ライブラリ。 SMILES/SDF/MOL 形式の解析、記述子の計算 (MW、LogP、TPSA)、フィンガープリントの生成 (Morgan、MACCS)、SMARTS による部分構造クエリの実行、2D/3D ジオメトリの作成、類似性の計算、および化学反応の実行。 ソース: aminoanalytica/amina-skills。
·rdkit
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rdkit
✓分子操作と分析のための Python ケモインフォマティクス ライブラリ。 SMILES/SDF/MOL 形式の解析、記述子の計算 (MW、LogP、TPSA)、フィンガープリントの生成 (Morgan、MACCS)、SMARTS による部分構造クエリの実行、2D/3D ジオメトリの作成、類似性の計算、および化学反応の実行。
rdkit のインストール方法
コマンドラインで rdkit AI スキルを開発環境にすばやくインストール
- ターミナルを開く: ターミナルまたはコマンドラインツール（Terminal、iTerm、Windows Terminal など）を開きます
- インストールコマンドを実行: このコマンドをコピーして実行します: npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill rdkit
- インストールを確認: インストール後、スキルは自動的に AI コーディング環境に設定され、Claude Code、Cursor、OpenClaw で使用できるようになります
ソース: aminoanalytica/amina-skills。
SKILL.md
原文を見るRDKit (v2023+) provides comprehensive Python APIs for molecular structure manipulation, property calculation, and chemical informatics. It requires Python 3 and NumPy, offering modular components for molecule parsing, descriptors, fingerprints, substructure search, conformer generation, and reaction processing.
| Molecule I/O | Parse SMILES, MOL, SDF, InChI; write structures | | Property Calculation | Molecular weight, LogP, TPSA, H-bond donors/acceptors | | Fingerprinting | Morgan (ECFP), MACCS keys, atom pairs, topological | | Similarity Analysis | Tanimoto, Dice, clustering compounds | | Substructure Search | SMARTS patterns, functional group detection |
| 3D Conformers | Generate, optimize, align molecular geometries | | Chemical Reactions | Define and execute transformations | | Drug-Likeness | Lipinski rules, QED, lead-likeness filters | | Visualization | 2D depictions, highlighting, grid images |
引用可能な情報
AI/検索での引用用の安定したフィールドとコマンド。
- インストールコマンド
npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill rdkit- カテゴリ
- {}データ分析
- 認証済み
- ✓
- 初回登録
- 2026-03-06
- 更新日
- 2026-03-10
クイックアンサー
rdkit のインストール方法は？
ターミナルまたはコマンドラインツール（Terminal、iTerm、Windows Terminal など）を開きます このコマンドをコピーして実行します: npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill rdkit インストール後、スキルは自動的に AI コーディング環境に設定され、Claude Code、Cursor、OpenClaw で使用できるようになります
ソースリポジトリはどこですか？
https://github.com/aminoanalytica/amina-skills
詳細
- カテゴリ
- {}データ分析
- ソース
- skills.sh
- 初回登録
- 2026-03-06