Biblioteca de quimioinformática Python para manipulación y análisis molecular. Analice formatos SMILES/SDF/MOL, calcule descriptores (MW, LogP, TPSA), genere huellas digitales (Morgan, MACCS), realice consultas de subestructura con SMARTS, cree geometrías 2D/3D, calcule similitudes y ejecute reacciones químicas.
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Fuente: aminoanalytica/amina-skills.
RDKit (v2023+) provides comprehensive Python APIs for molecular structure manipulation, property calculation, and chemical informatics. It requires Python 3 and NumPy, offering modular components for molecule parsing, descriptors, fingerprints, substructure search, conformer generation, and reaction processing.
| Molecule I/O | Parse SMILES, MOL, SDF, InChI; write structures | | Property Calculation | Molecular weight, LogP, TPSA, H-bond donors/acceptors | | Fingerprinting | Morgan (ECFP), MACCS keys, atom pairs, topological | | Similarity Analysis | Tanimoto, Dice, clustering compounds | | Substructure Search | SMARTS patterns, functional group detection |
| 3D Conformers | Generate, optimize, align molecular geometries | | Chemical Reactions | Define and execute transformations | | Drug-Likeness | Lipinski rules, QED, lead-likeness filters | | Visualization | 2D depictions, highlighting, grid images |
Campos y comandos estables para citas de IA/búsqueda.
npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill rdkitBiblioteca de quimioinformática Python para manipulación y análisis molecular. Analice formatos SMILES/SDF/MOL, calcule descriptores (MW, LogP, TPSA), genere huellas digitales (Morgan, MACCS), realice consultas de subestructura con SMARTS, cree geometrías 2D/3D, calcule similitudes y ejecute reacciones químicas. Fuente: aminoanalytica/amina-skills.
Abre tu terminal o herramienta de línea de comandos (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copia y ejecuta este comando: npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill rdkit Una vez instalado, el skill se configurará automáticamente en tu entorno de programación con IA y estará listo para usar en Claude Code, Cursor u OpenClaw
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