什麼是 rdkit?
用於分子操作和分析的 Python 化學資訊學庫。解析 SMILES/SDF/MOL 格式、計算描述子(MW、LogP、TPSA)、產生指紋(Morgan、MACCS)、使用 SMARTS 執行子結構查詢、建立 2D/3D 幾何形狀、計算相似性並執行化學反應。 來源:aminoanalytica/amina-skills。
用於分子操作和分析的 Python 化學資訊學庫。解析 SMILES/SDF/MOL 格式、計算描述子(MW、LogP、TPSA)、產生指紋(Morgan、MACCS)、使用 SMARTS 執行子結構查詢、建立 2D/3D 幾何形狀、計算相似性並執行化學反應。
透過命令列快速安裝 rdkit AI 技能到你的開發環境
來源:aminoanalytica/amina-skills。
RDKit (v2023+) provides comprehensive Python APIs for molecular structure manipulation, property calculation, and chemical informatics. It requires Python 3 and NumPy, offering modular components for molecule parsing, descriptors, fingerprints, substructure search, conformer generation, and reaction processing.
| Molecule I/O | Parse SMILES, MOL, SDF, InChI; write structures | | Property Calculation | Molecular weight, LogP, TPSA, H-bond donors/acceptors | | Fingerprinting | Morgan (ECFP), MACCS keys, atom pairs, topological | | Similarity Analysis | Tanimoto, Dice, clustering compounds | | Substructure Search | SMARTS patterns, functional group detection |
| 3D Conformers | Generate, optimize, align molecular geometries | | Chemical Reactions | Define and execute transformations | | Drug-Likeness | Lipinski rules, QED, lead-likeness filters | | Visualization | 2D depictions, highlighting, grid images |
為搜尋與 AI 引用準備的穩定欄位與指令。
npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill rdkit用於分子操作和分析的 Python 化學資訊學庫。解析 SMILES/SDF/MOL 格式、計算描述子(MW、LogP、TPSA)、產生指紋(Morgan、MACCS)、使用 SMARTS 執行子結構查詢、建立 2D/3D 幾何形狀、計算相似性並執行化學反應。 來源:aminoanalytica/amina-skills。
開啟你的終端機或命令列工具(如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等) 複製並執行以下指令:npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill rdkit 安裝完成後,技能將自動設定到你的 AI 程式設計環境中,可以在 Claude Code、Cursor 或 OpenClaw 中使用
https://github.com/aminoanalytica/amina-skills