·rdkit

用於分子操作和分析的 Python 化學資訊學庫。解析 SMILES/SDF/MOL 格式、計算描述子(MW、LogP、TPSA)、產生指紋(Morgan、MACCS)、使用 SMARTS 執行子結構查詢、建立 2D/3D 幾何形狀、計算相似性並執行化學反應。

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安裝

$npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill rdkit

如何安裝 rdkit

透過命令列快速安裝 rdkit AI 技能到你的開發環境

  1. 開啟終端機: 開啟你的終端機或命令列工具(如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等)
  2. 執行安裝指令: 複製並執行以下指令:npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill rdkit
  3. 驗證安裝: 安裝完成後,技能將自動設定到你的 AI 程式設計環境中,可以在 Claude Code、Cursor 或 OpenClaw 中使用

來源:aminoanalytica/amina-skills。

SKILL.md

查看原文

RDKit (v2023+) provides comprehensive Python APIs for molecular structure manipulation, property calculation, and chemical informatics. It requires Python 3 and NumPy, offering modular components for molecule parsing, descriptors, fingerprints, substructure search, conformer generation, and reaction processing.

| Molecule I/O | Parse SMILES, MOL, SDF, InChI; write structures | | Property Calculation | Molecular weight, LogP, TPSA, H-bond donors/acceptors | | Fingerprinting | Morgan (ECFP), MACCS keys, atom pairs, topological | | Similarity Analysis | Tanimoto, Dice, clustering compounds | | Substructure Search | SMARTS patterns, functional group detection |

| 3D Conformers | Generate, optimize, align molecular geometries | | Chemical Reactions | Define and execute transformations | | Drug-Likeness | Lipinski rules, QED, lead-likeness filters | | Visualization | 2D depictions, highlighting, grid images |

可引用資訊

為搜尋與 AI 引用準備的穩定欄位與指令。

安裝指令
npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill rdkit
分類
{}資料分析
認證
收錄時間
2026-03-06
更新時間
2026-03-10

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快速解答

什麼是 rdkit?

用於分子操作和分析的 Python 化學資訊學庫。解析 SMILES/SDF/MOL 格式、計算描述子(MW、LogP、TPSA)、產生指紋(Morgan、MACCS)、使用 SMARTS 執行子結構查詢、建立 2D/3D 幾何形狀、計算相似性並執行化學反應。 來源:aminoanalytica/amina-skills。

如何安裝 rdkit?

開啟你的終端機或命令列工具(如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等) 複製並執行以下指令:npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill rdkit 安裝完成後,技能將自動設定到你的 AI 程式設計環境中,可以在 Claude Code、Cursor 或 OpenClaw 中使用

這個 Skill 的原始碼在哪?

https://github.com/aminoanalytica/amina-skills