rdkit이란?
분자 조작 및 분석을 위한 Python 화학정보학 라이브러리입니다. SMILES/SDF/MOL 형식 구문 분석, 설명자 계산(MW, LogP, TPSA), 지문 생성(Morgan, MACCS), SMARTS를 사용한 하위 구조 쿼리 수행, 2D/3D 형상 생성, 유사성 계산 및 화학 반응 실행. 출처: aminoanalytica/amina-skills.
분자 조작 및 분석을 위한 Python 화학정보학 라이브러리입니다. SMILES/SDF/MOL 형식 구문 분석, 설명자 계산(MW, LogP, TPSA), 지문 생성(Morgan, MACCS), SMARTS를 사용한 하위 구조 쿼리 수행, 2D/3D 형상 생성, 유사성 계산 및 화학 반응 실행.
명령줄에서 rdkit AI 스킬을 개발 환경에 빠르게 설치
출처: aminoanalytica/amina-skills.
RDKit (v2023+) provides comprehensive Python APIs for molecular structure manipulation, property calculation, and chemical informatics. It requires Python 3 and NumPy, offering modular components for molecule parsing, descriptors, fingerprints, substructure search, conformer generation, and reaction processing.
| Molecule I/O | Parse SMILES, MOL, SDF, InChI; write structures | | Property Calculation | Molecular weight, LogP, TPSA, H-bond donors/acceptors | | Fingerprinting | Morgan (ECFP), MACCS keys, atom pairs, topological | | Similarity Analysis | Tanimoto, Dice, clustering compounds | | Substructure Search | SMARTS patterns, functional group detection |
| 3D Conformers | Generate, optimize, align molecular geometries | | Chemical Reactions | Define and execute transformations | | Drug-Likeness | Lipinski rules, QED, lead-likeness filters | | Visualization | 2D depictions, highlighting, grid images |
AI/검색 인용용 안정적인 필드와 명령어.
npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill rdkit분자 조작 및 분석을 위한 Python 화학정보학 라이브러리입니다. SMILES/SDF/MOL 형식 구문 분석, 설명자 계산(MW, LogP, TPSA), 지문 생성(Morgan, MACCS), SMARTS를 사용한 하위 구조 쿼리 수행, 2D/3D 형상 생성, 유사성 계산 및 화학 반응 실행. 출처: aminoanalytica/amina-skills.
터미널 또는 명령줄 도구(Terminal, iTerm, Windows Terminal 등)를 엽니다 이 명령어를 복사하여 실행합니다: npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill rdkit 설치 후 스킬은 자동으로 AI 코딩 환경에 설정되어 Claude Code, Cursor, OpenClaw에서 사용할 수 있습니다
https://github.com/aminoanalytica/amina-skills