Python-Cheminformatik-Bibliothek für molekulare Manipulation und Analyse. Analysieren Sie SMILES/SDF/MOL-Formate, berechnen Sie Deskriptoren (MW, LogP, TPSA), generieren Sie Fingerabdrücke (Morgan, MACCS), führen Sie Unterstrukturabfragen mit SMARTS durch, erstellen Sie 2D/3D-Geometrien, berechnen Sie Ähnlichkeiten und führen Sie chemische Reaktionen durch.
Installieren Sie den KI-Skill rdkit schnell in Ihrer Entwicklungsumgebung über die Kommandozeile
Quelle: aminoanalytica/amina-skills.
RDKit (v2023+) provides comprehensive Python APIs for molecular structure manipulation, property calculation, and chemical informatics. It requires Python 3 and NumPy, offering modular components for molecule parsing, descriptors, fingerprints, substructure search, conformer generation, and reaction processing.
| Molecule I/O | Parse SMILES, MOL, SDF, InChI; write structures | | Property Calculation | Molecular weight, LogP, TPSA, H-bond donors/acceptors | | Fingerprinting | Morgan (ECFP), MACCS keys, atom pairs, topological | | Similarity Analysis | Tanimoto, Dice, clustering compounds | | Substructure Search | SMARTS patterns, functional group detection |
| 3D Conformers | Generate, optimize, align molecular geometries | | Chemical Reactions | Define and execute transformations | | Drug-Likeness | Lipinski rules, QED, lead-likeness filters | | Visualization | 2D depictions, highlighting, grid images |
Stabile Felder und Befehle für KI/Such-Zitate.
npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill rdkitPython-Cheminformatik-Bibliothek für molekulare Manipulation und Analyse. Analysieren Sie SMILES/SDF/MOL-Formate, berechnen Sie Deskriptoren (MW, LogP, TPSA), generieren Sie Fingerabdrücke (Morgan, MACCS), führen Sie Unterstrukturabfragen mit SMARTS durch, erstellen Sie 2D/3D-Geometrien, berechnen Sie Ähnlichkeiten und führen Sie chemische Reaktionen durch. Quelle: aminoanalytica/amina-skills.
Öffnen Sie Ihr Terminal oder Kommandozeilen-Tool (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Kopieren Sie diesen Befehl und führen Sie ihn aus: npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill rdkit Nach der Installation wird der Skill automatisch in Ihrer KI-Programmierumgebung konfiguriert und ist bereit zur Verwendung in Claude Code, Cursor oder OpenClaw
https://github.com/aminoanalytica/amina-skills