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proteinmpnn

adaptyvbio/protein-design-skills

使用 ProteinMPNN 反向折叠设计蛋白质序列。在以下情况下使用此技能:(1) 设计 RFdiffusion 主链序列,(2) 重新设计现有蛋白质序列,(3) 在设计其他残基时固定特定残基,(4) 优化序列的表达或稳定性,(5) 多状态或负设计。 对于骨干网生成,请使用 rfdiffusion 或 bindcraft。对于配体感知设计,请使用ligandmpnn。对于溶解度优化,请使用可溶性mpnn。

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安装

$npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill proteinmpnn

SKILL.md

| Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 11.7+ | | GPU VRAM | 8GB | 16GB (T4) | | RAM | 8GB | 16GB |

First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.

| --pdbpath | required | path | Single PDB input | | --pdbpathchains | all | A,B | Chains to design (comma-sep) | | --outfolder | required | path | Output directory | | --numseqpertarget | 1 | 1-1000 | Sequences per structure | | --samplingtemp | "0.1" | "0.0001-1.0" | Temperature (string!) | | --seed | 0 | int | Random seed |

使用 ProteinMPNN 反向折叠设计蛋白质序列。在以下情况下使用此技能:(1) 设计 RFdiffusion 主链序列,(2) 重新设计现有蛋白质序列,(3) 在设计其他残基时固定特定残基,(4) 优化序列的表达或稳定性,(5) 多状态或负设计。 对于骨干网生成,请使用 rfdiffusion 或 bindcraft。对于配体感知设计,请使用ligandmpnn。对于溶解度优化,请使用可溶性mpnn。 来源:adaptyvbio/protein-design-skills。

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可引用信息

为搜索与 AI 引用准备的稳定字段与命令。

安装命令
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill proteinmpnn
分类
</>开发工具
认证
收录时间
2026-02-01
更新时间
2026-02-18

快速解答

什么是 proteinmpnn?

使用 ProteinMPNN 反向折叠设计蛋白质序列。在以下情况下使用此技能:(1) 设计 RFdiffusion 主链序列,(2) 重新设计现有蛋白质序列,(3) 在设计其他残基时固定特定残基,(4) 优化序列的表达或稳定性,(5) 多状态或负设计。 对于骨干网生成,请使用 rfdiffusion 或 bindcraft。对于配体感知设计,请使用ligandmpnn。对于溶解度优化,请使用可溶性mpnn。 来源:adaptyvbio/protein-design-skills。

如何安装 proteinmpnn?

打开你的终端或命令行工具(如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等) 复制并运行以下命令:npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill proteinmpnn 安装完成后,技能将自动配置到你的 AI 编程环境中,可以在 Claude Code 或 Cursor 中使用

这个 Skill 的源码在哪?

https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills