proteinmpnn
✓Concevez des séquences de protéines à l’aide du repliement inverse ProteinMPNN. Utilisez cette compétence lorsque : (1) Concevoir des séquences pour les squelettes de diffusion RF, (2) Reconcevoir des séquences protéiques existantes, (3) Fixer des résidus spécifiques lors de la conception d'autres, (4) Optimiser des séquences pour l'expression ou la stabilité, (5) Conception multi-états ou négative. Pour la génération de backbone, utilisez rfdiffusion ou bindcraft. Pour une conception prenant en compte les ligands, utilisez ligandmpnn. Pour optimiser la solubilité, utilisez solublempnn.
Installation
SKILL.md
| Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 11.7+ | | GPU VRAM | 8GB | 16GB (T4) | | RAM | 8GB | 16GB |
First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.
| --pdbpath | required | path | Single PDB input | | --pdbpathchains | all | A,B | Chains to design (comma-sep) | | --outfolder | required | path | Output directory | | --numseqpertarget | 1 | 1-1000 | Sequences per structure | | --samplingtemp | "0.1" | "0.0001-1.0" | Temperature (string!) | | --seed | 0 | int | Random seed |
Concevez des séquences de protéines à l’aide du repliement inverse ProteinMPNN. Utilisez cette compétence lorsque : (1) Concevoir des séquences pour les squelettes de diffusion RF, (2) Reconcevoir des séquences protéiques existantes, (3) Fixer des résidus spécifiques lors de la conception d'autres, (4) Optimiser des séquences pour l'expression ou la stabilité, (5) Conception multi-états ou négative. Pour la génération de backbone, utilisez rfdiffusion ou bindcraft. Pour une conception prenant en compte les ligands, utilisez ligandmpnn. Pour optimiser la solubilité, utilisez solublempnn. Source : adaptyvbio/protein-design-skills.
Faits (prêts à citer)
Champs et commandes stables pour les citations IA/recherche.
- Commande d'installation
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill proteinmpnn- Catégorie
- </>Développement
- Vérifié
- ✓
- Première apparition
- 2026-02-01
- Mis à jour
- 2026-02-18
Réponses rapides
Qu'est-ce que proteinmpnn ?
Concevez des séquences de protéines à l’aide du repliement inverse ProteinMPNN. Utilisez cette compétence lorsque : (1) Concevoir des séquences pour les squelettes de diffusion RF, (2) Reconcevoir des séquences protéiques existantes, (3) Fixer des résidus spécifiques lors de la conception d'autres, (4) Optimiser des séquences pour l'expression ou la stabilité, (5) Conception multi-états ou négative. Pour la génération de backbone, utilisez rfdiffusion ou bindcraft. Pour une conception prenant en compte les ligands, utilisez ligandmpnn. Pour optimiser la solubilité, utilisez solublempnn. Source : adaptyvbio/protein-design-skills.
Comment installer proteinmpnn ?
Ouvrez votre terminal ou outil de ligne de commande (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copiez et exécutez cette commande : npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill proteinmpnn Une fois installé, le skill sera automatiquement configuré dans votre environnement de programmation IA et prêt à être utilisé dans Claude Code ou Cursor
Où se trouve le dépôt source ?
https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills
Détails
- Catégorie
- </>Développement
- Source
- skills.sh
- Première apparition
- 2026-02-01