proteinmpnn
✓Diseñar secuencias de proteínas utilizando el plegamiento inverso de ProteinMPNN. Utilice esta habilidad cuando: (1) Diseñe secuencias para cadenas principales de difusión de RF, (2) Rediseñe secuencias de proteínas existentes, (3) Fije residuos específicos mientras diseña otros, (4) Optimice secuencias para expresión o estabilidad, (5) Diseño multiestado o negativo. Para la generación de columna vertebral, utilice rfdiffusion o bindcraft. Para un diseño compatible con ligandos, utilice ligandmpnn. Para optimizar la solubilidad, utilice solublempnn.
Instalación
SKILL.md
| Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 11.7+ | | GPU VRAM | 8GB | 16GB (T4) | | RAM | 8GB | 16GB |
First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.
| --pdbpath | required | path | Single PDB input | | --pdbpathchains | all | A,B | Chains to design (comma-sep) | | --outfolder | required | path | Output directory | | --numseqpertarget | 1 | 1-1000 | Sequences per structure | | --samplingtemp | "0.1" | "0.0001-1.0" | Temperature (string!) | | --seed | 0 | int | Random seed |
Diseñar secuencias de proteínas utilizando el plegamiento inverso de ProteinMPNN. Utilice esta habilidad cuando: (1) Diseñe secuencias para cadenas principales de difusión de RF, (2) Rediseñe secuencias de proteínas existentes, (3) Fije residuos específicos mientras diseña otros, (4) Optimice secuencias para expresión o estabilidad, (5) Diseño multiestado o negativo. Para la generación de columna vertebral, utilice rfdiffusion o bindcraft. Para un diseño compatible con ligandos, utilice ligandmpnn. Para optimizar la solubilidad, utilice solublempnn. Fuente: adaptyvbio/protein-design-skills.
Datos (listos para citar)
Campos y comandos estables para citas de IA/búsqueda.
- Comando de instalación
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill proteinmpnn- Categoría
- </>Desarrollo
- Verificado
- ✓
- Primera vez visto
- 2026-02-01
- Actualizado
- 2026-02-18
Respuestas rápidas
¿Qué es proteinmpnn?
Diseñar secuencias de proteínas utilizando el plegamiento inverso de ProteinMPNN. Utilice esta habilidad cuando: (1) Diseñe secuencias para cadenas principales de difusión de RF, (2) Rediseñe secuencias de proteínas existentes, (3) Fije residuos específicos mientras diseña otros, (4) Optimice secuencias para expresión o estabilidad, (5) Diseño multiestado o negativo. Para la generación de columna vertebral, utilice rfdiffusion o bindcraft. Para un diseño compatible con ligandos, utilice ligandmpnn. Para optimizar la solubilidad, utilice solublempnn. Fuente: adaptyvbio/protein-design-skills.
¿Cómo instalo proteinmpnn?
Abre tu terminal o herramienta de línea de comandos (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copia y ejecuta este comando: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill proteinmpnn Una vez instalado, el skill se configurará automáticamente en tu entorno de programación con IA y estará listo para usar en Claude Code o Cursor
¿Dónde está el repositorio de origen?
https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills
Detalles
- Categoría
- </>Desarrollo
- Fuente
- skills.sh
- Primera vez visto
- 2026-02-01