proteinmpnn
✓Entwerfen Sie Proteinsequenzen mithilfe der inversen ProteinMPNN-Faltung. Verwenden Sie diese Fähigkeit, wenn: (1) Sequenzen für RF-Diffusionsrückgrate entworfen werden, (2) vorhandene Proteinsequenzen neu gestaltet werden, (3) bestimmte Reste fixiert werden, während andere entworfen werden, (4) Sequenzen für Expression oder Stabilität optimiert werden, (5) Multi-State- oder Negativdesign. Verwenden Sie zur Backbone-Generierung RFDiffusion oder Bindcraft. Für ligandenbewusstes Design verwenden Sie ligandmpnn. Verwenden Sie zur Optimierung der Löslichkeit solviblempnn.
Installation
SKILL.md
| Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 11.7+ | | GPU VRAM | 8GB | 16GB (T4) | | RAM | 8GB | 16GB |
First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.
| --pdbpath | required | path | Single PDB input | | --pdbpathchains | all | A,B | Chains to design (comma-sep) | | --outfolder | required | path | Output directory | | --numseqpertarget | 1 | 1-1000 | Sequences per structure | | --samplingtemp | "0.1" | "0.0001-1.0" | Temperature (string!) | | --seed | 0 | int | Random seed |
Entwerfen Sie Proteinsequenzen mithilfe der inversen ProteinMPNN-Faltung. Verwenden Sie diese Fähigkeit, wenn: (1) Sequenzen für RF-Diffusionsrückgrate entworfen werden, (2) vorhandene Proteinsequenzen neu gestaltet werden, (3) bestimmte Reste fixiert werden, während andere entworfen werden, (4) Sequenzen für Expression oder Stabilität optimiert werden, (5) Multi-State- oder Negativdesign. Verwenden Sie zur Backbone-Generierung RFDiffusion oder Bindcraft. Für ligandenbewusstes Design verwenden Sie ligandmpnn. Verwenden Sie zur Optimierung der Löslichkeit solviblempnn. Quelle: adaptyvbio/protein-design-skills.
Fakten (zitierbereit)
Stabile Felder und Befehle für KI/Such-Zitate.
- Installationsbefehl
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill proteinmpnn- Kategorie
- </>Entwicklung
- Verifiziert
- ✓
- Erstes Auftreten
- 2026-02-01
- Aktualisiert
- 2026-02-18
Schnelle Antworten
Was ist proteinmpnn?
Entwerfen Sie Proteinsequenzen mithilfe der inversen ProteinMPNN-Faltung. Verwenden Sie diese Fähigkeit, wenn: (1) Sequenzen für RF-Diffusionsrückgrate entworfen werden, (2) vorhandene Proteinsequenzen neu gestaltet werden, (3) bestimmte Reste fixiert werden, während andere entworfen werden, (4) Sequenzen für Expression oder Stabilität optimiert werden, (5) Multi-State- oder Negativdesign. Verwenden Sie zur Backbone-Generierung RFDiffusion oder Bindcraft. Für ligandenbewusstes Design verwenden Sie ligandmpnn. Verwenden Sie zur Optimierung der Löslichkeit solviblempnn. Quelle: adaptyvbio/protein-design-skills.
Wie installiere ich proteinmpnn?
Öffnen Sie Ihr Terminal oder Kommandozeilen-Tool (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Kopieren Sie diesen Befehl und führen Sie ihn aus: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill proteinmpnn Nach der Installation wird der Skill automatisch in Ihrer KI-Programmierumgebung konfiguriert und ist bereit zur Verwendung in Claude Code oder Cursor
Wo ist das Quell-Repository?
https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills
Details
- Kategorie
- </>Entwicklung
- Quelle
- skills.sh
- Erstes Auftreten
- 2026-02-01