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proteinmpnn

adaptyvbio/protein-design-skills

使用 ProteinMPNN 反向折疊設計蛋白質序列。在以下情況下使用此技能:(1) 設計 RFdiffusion 主鏈序列,(2) 重新設計現有蛋白質序列,(3) 在設計其他殘基時固定特定殘基,(4) 優化序列的表達或穩定性,(5) 多狀態或負設計。 對於骨幹網生成,請使用 rfdiffusion 或 bindcraft。對於配體感知設計,請使用ligandmpnn。對於溶解度優化,請使用可溶性mpnn。

13安裝·0熱度·@adaptyvbio

安裝

$npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill proteinmpnn

SKILL.md

| Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 11.7+ | | GPU VRAM | 8GB | 16GB (T4) | | RAM | 8GB | 16GB |

First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.

| --pdbpath | required | path | Single PDB input | | --pdbpathchains | all | A,B | Chains to design (comma-sep) | | --outfolder | required | path | Output directory | | --numseqpertarget | 1 | 1-1000 | Sequences per structure | | --samplingtemp | "0.1" | "0.0001-1.0" | Temperature (string!) | | --seed | 0 | int | Random seed |

使用 ProteinMPNN 反向折疊設計蛋白質序列。在以下情況下使用此技能:(1) 設計 RFdiffusion 主鏈序列,(2) 重新設計現有蛋白質序列,(3) 在設計其他殘基時固定特定殘基,(4) 優化序列的表達或穩定性,(5) 多狀態或負設計。 對於骨幹網生成,請使用 rfdiffusion 或 bindcraft。對於配體感知設計,請使用ligandmpnn。對於溶解度優化,請使用可溶性mpnn。 來源:adaptyvbio/protein-design-skills。

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可引用資訊

為搜尋與 AI 引用準備的穩定欄位與指令。

安裝指令
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill proteinmpnn
分類
</>開發工具
認證
收錄時間
2026-02-01
更新時間
2026-02-18

快速解答

什麼是 proteinmpnn?

使用 ProteinMPNN 反向折疊設計蛋白質序列。在以下情況下使用此技能:(1) 設計 RFdiffusion 主鏈序列,(2) 重新設計現有蛋白質序列,(3) 在設計其他殘基時固定特定殘基,(4) 優化序列的表達或穩定性,(5) 多狀態或負設計。 對於骨幹網生成,請使用 rfdiffusion 或 bindcraft。對於配體感知設計,請使用ligandmpnn。對於溶解度優化,請使用可溶性mpnn。 來源:adaptyvbio/protein-design-skills。

如何安裝 proteinmpnn?

開啟你的終端機或命令列工具(如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等) 複製並執行以下指令:npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill proteinmpnn 安裝完成後,技能將自動設定到你的 AI 程式設計環境中,可以在 Claude Code 或 Cursor 中使用

這個 Skill 的原始碼在哪?

https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills