tooluniverse-metabolomics-analysis

Comprehensive analysis of metabolomics data from metabolite identification through quantification, statistical analysis, pathway interpretation, and integration with other omics layers.

| Data Import | LC-MS, GC-MS, NMR, targeted/untargeted platforms | | Metabolite Identification | Match to HMDB, KEGG, PubChem, spectral libraries | | Quality Control | Peak quality, blank subtraction, internal standard normalization | | Normalization | Probabilistic quotient, total ion current, internal standards |

| Statistical Analysis | Univariate and multivariate (PCA, PLS-DA, OPLS-DA) | | Differential Analysis | Identify significant metabolite changes | | Pathway Enrichment | KEGG, Reactome, BioCyc metabolic pathway analysis | | Metabolite-Enzyme Integration | Correlate with expression data | | Flux Analysis | Metabolic flux balance analysis (FBA) |

代謝物の同定、定量化、経路分析、代謝フラックスなどのメタボロミクス データを分析します。ターゲットおよび非ターゲット実験からの LC-MS、GC-MS、NMR データを処理します。正規化、統計分析、経路の強化、代謝産物と酵素の統合、バイオマーカーの発見を実行します。メタボロミクス データセットの分析、差次的代謝産物の特定、代謝経路の研究、トランスクリプトミクス/プロテオミクスとの統合、代謝バイオマーカーの発見、フラックス バランス分析の実行、または疾患、薬物反応、または生理学的状態における代謝表現型の特徴付けを行う場合に使用します。 ソース: mims-harvard/tooluniverse。