Comprehensive analysis of metabolomics data from metabolite identification through quantification, statistical analysis, pathway interpretation, and integration with other omics layers.
| Data Import | LC-MS, GC-MS, NMR, targeted/untargeted platforms | | Metabolite Identification | Match to HMDB, KEGG, PubChem, spectral libraries | | Quality Control | Peak quality, blank subtraction, internal standard normalization | | Normalization | Probabilistic quotient, total ion current, internal standards |
| Statistical Analysis | Univariate and multivariate (PCA, PLS-DA, OPLS-DA) | | Differential Analysis | Identify significant metabolite changes | | Pathway Enrichment | KEGG, Reactome, BioCyc metabolic pathway analysis | | Metabolite-Enzyme Integration | Correlate with expression data | | Flux Analysis | Metabolic flux balance analysis (FBA) |
Анализируйте данные метаболомики, включая идентификацию метаболитов, количественную оценку, анализ путей и метаболический поток. Обрабатывает данные ЖХ-МС, ГХ-МС, ЯМР целевых и нецелевых экспериментов. Выполняет нормализацию, статистический анализ, обогащение путей, интеграцию метаболитов и ферментов и обнаружение биомаркеров. Используйте при анализе наборов метаболомических данных, выявлении дифференциальных метаболитов, изучении метаболических путей, интеграции с транскриптомикой/протеомикой, обнаружении метаболических биомаркеров, выполнении анализа баланса потоков или характеристике метаболических фенотипов при заболевании, реакции на лекарства или физиологических состояниях. Источник: mims-harvard/tooluniverse.