tooluniverse-metabolomics-analysis

Comprehensive analysis of metabolomics data from metabolite identification through quantification, statistical analysis, pathway interpretation, and integration with other omics layers.

| Data Import | LC-MS, GC-MS, NMR, targeted/untargeted platforms | | Metabolite Identification | Match to HMDB, KEGG, PubChem, spectral libraries | | Quality Control | Peak quality, blank subtraction, internal standard normalization | | Normalization | Probabilistic quotient, total ion current, internal standards |

| Statistical Analysis | Univariate and multivariate (PCA, PLS-DA, OPLS-DA) | | Differential Analysis | Identify significant metabolite changes | | Pathway Enrichment | KEGG, Reactome, BioCyc metabolic pathway analysis | | Metabolite-Enzyme Integration | Correlate with expression data | | Flux Analysis | Metabolic flux balance analysis (FBA) |

Analysieren Sie Metabolomics-Daten, einschließlich Metabolitenidentifizierung, Quantifizierung, Signalweganalyse und Stoffwechselfluss. Verarbeitet LC-MS-, GC-MS- und NMR-Daten aus gezielten und ungezielten Experimenten. Führt Normalisierung, statistische Analyse, Signalweganreicherung, Metabolit-Enzym-Integration und Biomarker-Erkennung durch. Zur Verwendung bei der Analyse von Metabolomik-Datensätzen, der Identifizierung unterschiedlicher Metaboliten, der Untersuchung von Stoffwechselwegen, der Integration mit Transkriptomik/Proteomik, der Entdeckung metabolischer Biomarker, der Durchführung von Flussbilanzanalysen oder der Charakterisierung metabolischer Phänotypen bei Krankheiten, Arzneimittelreaktionen oder physiologischen Zuständen. Quelle: mims-harvard/tooluniverse.