tooluniverse-metabolomics-analysis

Comprehensive analysis of metabolomics data from metabolite identification through quantification, statistical analysis, pathway interpretation, and integration with other omics layers.

| Data Import | LC-MS, GC-MS, NMR, targeted/untargeted platforms | | Metabolite Identification | Match to HMDB, KEGG, PubChem, spectral libraries | | Quality Control | Peak quality, blank subtraction, internal standard normalization | | Normalization | Probabilistic quotient, total ion current, internal standards |

| Statistical Analysis | Univariate and multivariate (PCA, PLS-DA, OPLS-DA) | | Differential Analysis | Identify significant metabolite changes | | Pathway Enrichment | KEGG, Reactome, BioCyc metabolic pathway analysis | | Metabolite-Enzyme Integration | Correlate with expression data | | Flux Analysis | Metabolic flux balance analysis (FBA) |

Analysez les données métabolomiques, notamment l’identification, la quantification, l’analyse des voies et le flux métabolique des métabolites. Traite les données LC-MS, GC-MS, RMN provenant d’expériences ciblées et non ciblées. Effectue la normalisation, l'analyse statistique, l'enrichissement des voies, l'intégration des métabolites et des enzymes et la découverte de biomarqueurs. À utiliser pour analyser des ensembles de données métabolomique, identifier des métabolites différentiels, étudier les voies métaboliques, intégrer la transcriptomique/protéomique, découvrir des biomarqueurs métaboliques, effectuer une analyse du bilan de flux ou caractériser des phénotypes métaboliques dans une maladie, une réponse médicamenteuse ou des conditions physiologiques. Source : mims-harvard/tooluniverse.