Comprehensive analysis of metabolomics data from metabolite identification through quantification, statistical analysis, pathway interpretation, and integration with other omics layers.
| Data Import | LC-MS, GC-MS, NMR, targeted/untargeted platforms | | Metabolite Identification | Match to HMDB, KEGG, PubChem, spectral libraries | | Quality Control | Peak quality, blank subtraction, internal standard normalization | | Normalization | Probabilistic quotient, total ion current, internal standards |
| Statistical Analysis | Univariate and multivariate (PCA, PLS-DA, OPLS-DA) | | Differential Analysis | Identify significant metabolite changes | | Pathway Enrichment | KEGG, Reactome, BioCyc metabolic pathway analysis | | Metabolite-Enzyme Integration | Correlate with expression data | | Flux Analysis | Metabolic flux balance analysis (FBA) |
تحليل بيانات التمثيل الغذائي بما في ذلك تحديد المستقلب، والقياس الكمي، وتحليل المسار، والتدفق الأيضي. يعالج بيانات LC-MS وGC-MS وNMR من التجارب المستهدفة وغير المستهدفة. يقوم بإجراء التطبيع، والتحليل الإحصائي، وإثراء المسار، وتكامل الإنزيم الأيضي، واكتشاف العلامات الحيوية. يُستخدم عند تحليل مجموعات بيانات التمثيل الغذائي، أو تحديد المستقلبات التفاضلية، أو دراسة مسارات التمثيل الغذائي، أو التكامل مع علم النسخ/البروتينات، أو اكتشاف المؤشرات الحيوية الأيضية، أو إجراء تحليل توازن التدفق، أو توصيف الأنماط الظاهرية الأيضية في المرض، أو الاستجابة للأدوية، أو الحالات الفسيولوجية. المصدر: mims-harvard/tooluniverse.