Comprehensive analysis of metabolomics data from metabolite identification through quantification, statistical analysis, pathway interpretation, and integration with other omics layers.
| Data Import | LC-MS, GC-MS, NMR, targeted/untargeted platforms | | Metabolite Identification | Match to HMDB, KEGG, PubChem, spectral libraries | | Quality Control | Peak quality, blank subtraction, internal standard normalization | | Normalization | Probabilistic quotient, total ion current, internal standards |
| Statistical Analysis | Univariate and multivariate (PCA, PLS-DA, OPLS-DA) | | Differential Analysis | Identify significant metabolite changes | | Pathway Enrichment | KEGG, Reactome, BioCyc metabolic pathway analysis | | Metabolite-Enzyme Integration | Correlate with expression data | | Flux Analysis | Metabolic flux balance analysis (FBA) |
Analice datos metabolómicos, incluida la identificación de metabolitos, la cuantificación, el análisis de vías y el flujo metabólico. Procesa datos de LC-MS, GC-MS y NMR de experimentos específicos y no específicos. Realiza normalización, análisis estadístico, enriquecimiento de vías, integración de metabolitos-enzimas y descubrimiento de biomarcadores. Úselo al analizar conjuntos de datos de metabolómica, identificar metabolitos diferenciales, estudiar rutas metabólicas, integrar con transcriptómica/proteómica, descubrir biomarcadores metabólicos, realizar análisis de equilibrio de flujo o caracterizar fenotipos metabólicos en enfermedades, respuesta a medicamentos o condiciones fisiológicas. Fuente: mims-harvard/tooluniverse.