tooluniverse-expression-data-retrieval
✓ArrayExpress および BioStudies から遺伝子発現およびオミクス データセットを取得し、遺伝子の明確化、実験の品質評価、および構造化されたレポートを提供します。メタデータ、サンプル情報、ダウンロード リンクを含む包括的なデータセット プロファイルを作成します。ユーザーが発現データ、オミクス データセットを必要とする場合、または ArrayExpress (E-MTAB、E-GEOD) または BioStudies (S-BSST) アクセッションについて言及する場合に使用します。
SKILL.md
Retrieve gene expression experiments and multi-omics datasets with proper disambiguation and quality assessment.
| Specific accession | Direct retrieval | | Gene + condition | "[gene] [condition]" + species filter | | Disease only | "[disease]" + species filter | | Technology-specific | Add platform keywords (RNA-seq, microarray) |
| ArrayExpress search | BioStudies search | ArrayExpress empty | | arrayexpressgetexperimentdetails | biostudiesgetstudydetails | E-GEOD may have BioStudies mirror | | arrayexpressgetexperimentfiles | Note "Files unavailable" | Some studies restrict downloads |
ArrayExpress および BioStudies から遺伝子発現およびオミクス データセットを取得し、遺伝子の明確化、実験の品質評価、および構造化されたレポートを提供します。メタデータ、サンプル情報、ダウンロード リンクを含む包括的なデータセット プロファイルを作成します。ユーザーが発現データ、オミクス データセットを必要とする場合、または ArrayExpress (E-MTAB、E-GEOD) または BioStudies (S-BSST) アクセッションについて言及する場合に使用します。 ソース: mims-harvard/tooluniverse。
引用可能な情報
AI/検索での引用用の安定したフィールドとコマンド。
- インストールコマンド
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-expression-data-retrieval- カテゴリ
- {}データ分析
- 認証済み
- ✓
- 初回登録
- 2026-02-05
- 更新日
- 2026-02-18
クイックアンサー
tooluniverse-expression-data-retrieval とは？
ArrayExpress および BioStudies から遺伝子発現およびオミクス データセットを取得し、遺伝子の明確化、実験の品質評価、および構造化されたレポートを提供します。メタデータ、サンプル情報、ダウンロード リンクを含む包括的なデータセット プロファイルを作成します。ユーザーが発現データ、オミクス データセットを必要とする場合、または ArrayExpress (E-MTAB、E-GEOD) または BioStudies (S-BSST) アクセッションについて言及する場合に使用します。 ソース: mims-harvard/tooluniverse。
tooluniverse-expression-data-retrieval のインストール方法は？
ターミナルまたはコマンドラインツール（Terminal、iTerm、Windows Terminal など）を開きます このコマンドをコピーして実行します: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-expression-data-retrieval インストール後、スキルは自動的に AI コーディング環境に設定され、Claude Code や Cursor で使用できるようになります
ソースリポジトリはどこですか？
https://github.com/mims-harvard/tooluniverse