tooluniverse-expression-data-retrieval

SKILL.md

Retrieve gene expression experiments and multi-omics datasets with proper disambiguation and quality assessment.

| Specific accession | Direct retrieval | | Gene + condition | "[gene] [condition]" + species filter | | Disease only | "[disease]" + species filter | | Technology-specific | Add platform keywords (RNA-seq, microarray) |

| ArrayExpress search | BioStudies search | ArrayExpress empty | | arrayexpressgetexperimentdetails | biostudiesgetstudydetails | E-GEOD may have BioStudies mirror | | arrayexpressgetexperimentfiles | Note "Files unavailable" | Some studies restrict downloads |

유전자 명확성, 실험 품질 평가 및 구조화된 보고서를 통해 ArrayExpress 및 BioStudies에서 유전자 발현 및 오믹스 데이터 세트를 검색합니다. 메타데이터, 샘플 정보 및 다운로드 링크가 포함된 포괄적인 데이터세트 프로필을 생성합니다. 사용자가 발현 데이터, 오믹스 데이터세트가 필요하거나 ArrayExpress(E-MTAB, E-GEOD) 또는 BioStudies(S-BSST) 접근을 언급할 때 사용합니다. 출처: mims-harvard/tooluniverse.

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