tooluniverse-expression-data-retrieval
✓從 ArrayExpress 和 BioStudies 檢索基因表達和組學數據集,並進行基因消歧、實驗質量評估和結構化報告。使用元數據、示例信息和下載鏈接創建全面的數據集配置文件。當用戶需要表達數據、組學數據集或提及 ArrayExpress(E-MTAB、E-GEOD)或 BioStudies (S-BSST) 種質時使用。
SKILL.md
Retrieve gene expression experiments and multi-omics datasets with proper disambiguation and quality assessment.
| Specific accession | Direct retrieval | | Gene + condition | "[gene] [condition]" + species filter | | Disease only | "[disease]" + species filter | | Technology-specific | Add platform keywords (RNA-seq, microarray) |
| ArrayExpress search | BioStudies search | ArrayExpress empty | | arrayexpressgetexperimentdetails | biostudiesgetstudydetails | E-GEOD may have BioStudies mirror | | arrayexpressgetexperimentfiles | Note "Files unavailable" | Some studies restrict downloads |
從 ArrayExpress 和 BioStudies 檢索基因表達和組學數據集,並進行基因消歧、實驗質量評估和結構化報告。使用元數據、示例信息和下載鏈接創建全面的數據集配置文件。當用戶需要表達數據、組學數據集或提及 ArrayExpress(E-MTAB、E-GEOD)或 BioStudies (S-BSST) 種質時使用。 來源:mims-harvard/tooluniverse。
可引用資訊
為搜尋與 AI 引用準備的穩定欄位與指令。
- 安裝指令
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-expression-data-retrieval- 分類
- {}資料分析
- 認證
- ✓
- 收錄時間
- 2026-02-05
- 更新時間
- 2026-02-18
快速解答
什麼是 tooluniverse-expression-data-retrieval?
從 ArrayExpress 和 BioStudies 檢索基因表達和組學數據集,並進行基因消歧、實驗質量評估和結構化報告。使用元數據、示例信息和下載鏈接創建全面的數據集配置文件。當用戶需要表達數據、組學數據集或提及 ArrayExpress(E-MTAB、E-GEOD)或 BioStudies (S-BSST) 種質時使用。 來源:mims-harvard/tooluniverse。
如何安裝 tooluniverse-expression-data-retrieval?
開啟你的終端機或命令列工具(如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等) 複製並執行以下指令:npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-expression-data-retrieval 安裝完成後,技能將自動設定到你的 AI 程式設計環境中,可以在 Claude Code 或 Cursor 中使用
這個 Skill 的原始碼在哪?
https://github.com/mims-harvard/tooluniverse