tooluniverse-expression-data-retrieval
✓从 ArrayExpress 和 BioStudies 检索基因表达和组学数据集,并进行基因消歧、实验质量评估和结构化报告。使用元数据、示例信息和下载链接创建全面的数据集配置文件。当用户需要表达数据、组学数据集或提及 ArrayExpress(E-MTAB、E-GEOD)或 BioStudies (S-BSST) 加入时使用。
SKILL.md
Retrieve gene expression experiments and multi-omics datasets with proper disambiguation and quality assessment.
| Specific accession | Direct retrieval | | Gene + condition | "[gene] [condition]" + species filter | | Disease only | "[disease]" + species filter | | Technology-specific | Add platform keywords (RNA-seq, microarray) |
| ArrayExpress search | BioStudies search | ArrayExpress empty | | arrayexpressgetexperimentdetails | biostudiesgetstudydetails | E-GEOD may have BioStudies mirror | | arrayexpressgetexperimentfiles | Note "Files unavailable" | Some studies restrict downloads |
从 ArrayExpress 和 BioStudies 检索基因表达和组学数据集,并进行基因消歧、实验质量评估和结构化报告。使用元数据、示例信息和下载链接创建全面的数据集配置文件。当用户需要表达数据、组学数据集或提及 ArrayExpress(E-MTAB、E-GEOD)或 BioStudies (S-BSST) 加入时使用。 来源:mims-harvard/tooluniverse。
可引用信息
为搜索与 AI 引用准备的稳定字段与命令。
- 安装命令
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-expression-data-retrieval- 分类
- {}数据分析
- 认证
- ✓
- 收录时间
- 2026-02-05
- 更新时间
- 2026-02-18
快速解答
什么是 tooluniverse-expression-data-retrieval?
从 ArrayExpress 和 BioStudies 检索基因表达和组学数据集,并进行基因消歧、实验质量评估和结构化报告。使用元数据、示例信息和下载链接创建全面的数据集配置文件。当用户需要表达数据、组学数据集或提及 ArrayExpress(E-MTAB、E-GEOD)或 BioStudies (S-BSST) 加入时使用。 来源:mims-harvard/tooluniverse。
如何安装 tooluniverse-expression-data-retrieval?
打开你的终端或命令行工具(如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等) 复制并运行以下命令:npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-expression-data-retrieval 安装完成后,技能将自动配置到你的 AI 编程环境中,可以在 Claude Code 或 Cursor 中使用
这个 Skill 的源码在哪?
https://github.com/mims-harvard/tooluniverse