·tooluniverse-expression-data-retrieval
{}

tooluniverse-expression-data-retrieval

mims-harvard/tooluniverse

Recupera conjuntos de datos ómicos y de expresión genética de ArrayExpress y BioStudies con desambiguación de genes, evaluación de la calidad de los experimentos e informes estructurados. Crea perfiles completos de conjuntos de datos con metadatos, información de muestra y enlaces de descarga. Utilícelo cuando los usuarios necesiten datos de expresión, conjuntos de datos ómicos o mencionen accesiones de ArrayExpress (E-MTAB, E-GEOD) o BioStudies (S-BSST).

35Instalaciones·4Tendencia·@mims-harvard

Instalación

$npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-expression-data-retrieval

SKILL.md

Retrieve gene expression experiments and multi-omics datasets with proper disambiguation and quality assessment.

| Specific accession | Direct retrieval | | Gene + condition | "[gene] [condition]" + species filter | | Disease only | "[disease]" + species filter | | Technology-specific | Add platform keywords (RNA-seq, microarray) |

| ArrayExpress search | BioStudies search | ArrayExpress empty | | arrayexpressgetexperimentdetails | biostudiesgetstudydetails | E-GEOD may have BioStudies mirror | | arrayexpressgetexperimentfiles | Note "Files unavailable" | Some studies restrict downloads |

Recupera conjuntos de datos ómicos y de expresión genética de ArrayExpress y BioStudies con desambiguación de genes, evaluación de la calidad de los experimentos e informes estructurados. Crea perfiles completos de conjuntos de datos con metadatos, información de muestra y enlaces de descarga. Utilícelo cuando los usuarios necesiten datos de expresión, conjuntos de datos ómicos o mencionen accesiones de ArrayExpress (E-MTAB, E-GEOD) o BioStudies (S-BSST). Fuente: mims-harvard/tooluniverse.

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Datos (listos para citar)

Campos y comandos estables para citas de IA/búsqueda.

Comando de instalación
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-expression-data-retrieval
Categoría
{}Análisis de Datos
Verificado
Primera vez visto
2026-02-05
Actualizado
2026-02-18

Respuestas rápidas

¿Qué es tooluniverse-expression-data-retrieval?

Recupera conjuntos de datos ómicos y de expresión genética de ArrayExpress y BioStudies con desambiguación de genes, evaluación de la calidad de los experimentos e informes estructurados. Crea perfiles completos de conjuntos de datos con metadatos, información de muestra y enlaces de descarga. Utilícelo cuando los usuarios necesiten datos de expresión, conjuntos de datos ómicos o mencionen accesiones de ArrayExpress (E-MTAB, E-GEOD) o BioStudies (S-BSST). Fuente: mims-harvard/tooluniverse.

¿Cómo instalo tooluniverse-expression-data-retrieval?

Abre tu terminal o herramienta de línea de comandos (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copia y ejecuta este comando: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-expression-data-retrieval Una vez instalado, el skill se configurará automáticamente en tu entorno de programación con IA y estará listo para usar en Claude Code o Cursor

¿Dónde está el repositorio de origen?

https://github.com/mims-harvard/tooluniverse