tooluniverse-expression-data-retrieval
✓Récupère l'expression génique et les ensembles de données omiques d'ArrayExpress et BioStudies avec une désambiguïsation des gènes, une évaluation de la qualité des expériences et des rapports structurés. Crée des profils d'ensemble de données complets avec des métadonnées, des exemples d'informations et des liens de téléchargement. À utiliser lorsque les utilisateurs ont besoin de données d'expression, d'ensembles de données omiques ou mentionnent des accessions ArrayExpress (E-MTAB, E-GEOD) ou BioStudies (S-BSST).
Installation
SKILL.md
Retrieve gene expression experiments and multi-omics datasets with proper disambiguation and quality assessment.
| Specific accession | Direct retrieval | | Gene + condition | "[gene] [condition]" + species filter | | Disease only | "[disease]" + species filter | | Technology-specific | Add platform keywords (RNA-seq, microarray) |
| ArrayExpress search | BioStudies search | ArrayExpress empty | | arrayexpressgetexperimentdetails | biostudiesgetstudydetails | E-GEOD may have BioStudies mirror | | arrayexpressgetexperimentfiles | Note "Files unavailable" | Some studies restrict downloads |
Récupère l'expression génique et les ensembles de données omiques d'ArrayExpress et BioStudies avec une désambiguïsation des gènes, une évaluation de la qualité des expériences et des rapports structurés. Crée des profils d'ensemble de données complets avec des métadonnées, des exemples d'informations et des liens de téléchargement. À utiliser lorsque les utilisateurs ont besoin de données d'expression, d'ensembles de données omiques ou mentionnent des accessions ArrayExpress (E-MTAB, E-GEOD) ou BioStudies (S-BSST). Source : mims-harvard/tooluniverse.
Faits (prêts à citer)
Champs et commandes stables pour les citations IA/recherche.
- Commande d'installation
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-expression-data-retrieval- Catégorie
- {}Analyse de Données
- Vérifié
- ✓
- Première apparition
- 2026-02-05
- Mis à jour
- 2026-02-18
Réponses rapides
Qu'est-ce que tooluniverse-expression-data-retrieval ?
Récupère l'expression génique et les ensembles de données omiques d'ArrayExpress et BioStudies avec une désambiguïsation des gènes, une évaluation de la qualité des expériences et des rapports structurés. Crée des profils d'ensemble de données complets avec des métadonnées, des exemples d'informations et des liens de téléchargement. À utiliser lorsque les utilisateurs ont besoin de données d'expression, d'ensembles de données omiques ou mentionnent des accessions ArrayExpress (E-MTAB, E-GEOD) ou BioStudies (S-BSST). Source : mims-harvard/tooluniverse.
Comment installer tooluniverse-expression-data-retrieval ?
Ouvrez votre terminal ou outil de ligne de commande (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copiez et exécutez cette commande : npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-expression-data-retrieval Une fois installé, le skill sera automatiquement configuré dans votre environnement de programmation IA et prêt à être utilisé dans Claude Code ou Cursor
Où se trouve le dépôt source ?
https://github.com/mims-harvard/tooluniverse
Détails
- Catégorie
- {}Analyse de Données
- Source
- skills.sh
- Première apparition
- 2026-02-05